本书是德国古典哲学演进过程中的一座里程碑，通常也被看作谢林早期哲学最重要的代表作。谢林本人对这部著作同样十分重视，他在晚年撰写的《近代哲学史》里明确指出：“如果你们……想要准确而原原本本地了解近代哲学的逐渐发展过程，那么我只能推荐他去研究这部《先验唯心论体系》。”
在这部著作里，谢林展示了自我如何基于自身的原初同一性和二重性结构，经过无意识地生产出外部世界而最终达到自我意识的过程，进而建立了一个包揽理论哲学、实践哲学和目的论，并且以艺术哲学为封顶石的完整体系。这个体系作为谢林早期哲学的枢纽，比他此前的自然哲学体系更为全面，也比他此后的同一性哲学体系更具有辩证法的活力。
《先验唯心论体系》的重要意义尤其在于，谢林在这里第一次揭示出自然界和精神世界在本质上的同一性和结构上的一致性，并且第一次系统性地运用辩证的方法把全部哲学阐述为自我意识的不断前进的历史，更将哲学家的思考与客观自我的发展之间的关系阐释为柏拉图式的回忆和对话。这些思想和方法对黑格尔哲学产生了决定性的影响。
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