1 磷元素与生命调控过程
1.1 引言
1.2 磷元素的发现
1.3 磷元素与生命过程密切相关
1.3.1 DNA双螺旋结构
1.3.2 磷元素的不可替代性
1.3.3 植物光合磷酸化过程
1.4 磷元素与能量代谢
1.4.1 能量代谢过程的高能磷分子
1.4.2 ATP新生物功能的发现
1.4.3 NAD/NADH氧化-还原过程
1.4.4 磷元素与氨基酸代谢
1.5 磷脂的化学结构与功能
1.6 核酸的结构、合成与水解过程
1.7 生命体系中的P—N化学键结构
1.8 磷酰基转移过程机理
1.9 蛋白质的生物合成
1.10 蛋白翻译后修饰
1.10.1 蛋白可逆磷酸化修饰
1.10.2 微生物双组分系统中磷酸化调控机制
1.10.3 蛋白ADP核糖基化修饰
1.11 磷元素与疾病发生和治疗药物开发
1.12 小结
参考文献
2 磷与核酸
2.1 核酸的组成与结构
2.1.1 核酸的结构征与分离
2.1.2 核酸中磷元素的化学性质
2.2 核酸磷酸骨架的化学修饰及其应用
2.2.1 核酸磷酸二酯键的稳定性
2.2.2 核酸磷酸骨架的人工化学修饰
2.2.3 DNA磷酸骨架的天然化学修饰
2.3 核酸碱基及糖环的化学修饰及其应用
2.4 G-四链核酸及其配体分子设计
2.4.1 G-四链核酸
2.4.2 G-四链RNA
2.4.3 G-四链核酸的配体分子设计
2.5 小结
参考文献
3 基于核酸的适配体和基因编辑技术
3.1 核酸适配体及其在疾病诊断中的应用
3.1.1 核酸适配体
3.1.2 疾病诊断中的应用
3.2 DNA修复与编辑
3.2.1 DNA修复过程的磷化学机制
3.2.2 DNA编辑过程的磷化学调控机制
3.3 小结
参考文献
4 蛋白质的O-磷酸化修饰
4.1 引言
4.2 O-磷酸化与神经退行性疾病
4.2.1 O-磷酸化和阿尔茨海默病相关的Tau蛋白
4.2.2 O-磷酸化和阿尔茨海默病相关的β-淀粉样蛋白
4.2.3 O-磷酸化和帕金森病相关的α-核突触蛋白
4.2.4 O-磷酸化和肌萎缩侧索硬化症相关的TDP
4.3 小结
参考文献
5 磷酸化修饰与真核基因转录延伸调控过程
5.1 磷酸化修饰与真核基因转录循环过程
5.1.1 RNA聚合酶的组成和功能
5.1.2 CTD的殊结构
5.1.3 CTD的磷酸化修饰
5.1.4 CTD的去磷酸化
5.2 正性转录延伸因子P-TEFb的结构和功能
5.3 正性转录延伸因子P-TEFb的活性和调控
5.3.1 非活性状态复合物——7SK snRNP
5.3.2 HIV-1基因转录调控
5.3.3 激酶活性状态复合物——SEC
5.3.4 激酶活性状态复合物——BEC
5.4 小结
参考文献
6 磷酸化修饰与细胞程序性坏死
6.1 激酶RIPK
6.1.1 激酶RIPK3的发现
6.1.2 RIPK3的C端同源结构域——RHIM结构域
6.1.3 Ripk3基因敲除的小鼠
6.2 细胞程序性坏死
6.2.1 细胞程序性坏死现象
6.2.2 RIPK1激酶活性抑制剂的发现
6.3 细胞程序性坏死的开关分子——RIPK3激酶
6.3.1 RIPK3激活细胞程序性坏死的现象
6.3.2 RIPK3介导细胞程序性坏死的机制
6.3.3 RIPK3激酶底物的发现
6.4 RIPK3与凋亡信号间的互作机制
6.4.1 caspase-8限制细胞程序性坏死的发生
6.4.2 RIPK3抑制细胞程序性凋亡信号的机制
6.4.3 RIPK1参与RIPK3对凋亡信号的抑制
6.4.4 激酶RSK是参与RIPK3对凋亡抑制的关键分子
6.5 RIPK3-RIPK1为核心的纤维状结构
6.6 RIPK3介导细胞坏死的生物学功能
6.6.1 RIPK3介导的细胞坏死与抗病毒免疫
6.6.2 RIPK3与炎症型疾病密切相关
6.7 总结和展望
参考文献
7 蛋白质磷酸化选择性富集方法
7.1 蛋白质磷酸化概述
7.2 蛋白质磷酸化选择性富集方法
7.2.1 亲和富集法
7.2.2 固定化金属离子亲和色谱法
7.2.3 金属氧化物亲和色谱法
7.2.4 智能聚合物
7.2.5 离子交换色谱法
7.2.6 亲水相互作用色谱法
7.2.7 化学修饰法
7.2.8 金属磷酸化盐沉淀
7.2.9 Phos-Tag标签
7.2.10 其他富集方法
7.3 磷酸化肽富集方法的优化和改进
7.3.1 富集材料设计的改进
7.3.2 富集方式的改进
7.3.3 富集异性的改进
7.3.4 时空分辨的磷酸化研究
7.3.5 非典型性磷酸化肽段富集
7.4 总结和展望
参考文献
8 生命体中多聚磷酸盐代谢及其功能
8.1 多聚磷酸盐概述
8.2 多聚磷酸盐代谢
8.2.1 多聚磷酸盐合成代谢和关键酶
8.2.2 多聚磷酸盐分解代谢和关键酶
8.3 多聚磷酸盐的生物学功能与进化意义
8.3.1 多聚磷酸盐的生物学功能
8.3.2 多聚磷酸盐与生命起源
8.4 多聚磷酸盐的应用价值
参考文献
9 信号转导系统与含磷第二信使
9.1 环化核苷酸
9.2 环化双核苷酸
9.2.1 环二鸟苷酸
9.2.2 环二腺苷酸
9.2.3 环-鸟苷酸-腺苷酸
9.3
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