作者说在《世界史的构造》这本书里，他从交换样式（而非生产方式）的角度，对人类社会历史进行了重新思索，并在交换样式A、B、C之外，发现了交换样式D。作者还指出，交换样式D必然收敛为宗教的形态，而在遥远的伊奥尼亚时代的政治和思想中，恰恰曾经存在过这具有普遍意义的宝贵精神财富。但当时因为篇幅的原因，未能充分探讨，于是另外写了《哲学的起源》这本书作为前书的续篇，试图对上述问题进行深入考察。

汪晖评柄谷行人《哲学的起源》
赵京华评柄谷行人《哲学的起源》
序论
1 普世宗教
2 伦理型先知
3 模范型先知
第一章 伊奥尼亚的社会与思想
1 雅典与伊奥尼亚
2 Isonomia与Democracy
3 雅典的Democracy
4 国家与民主主义
5 移民与Isonomia
6 冰岛与北美洲
7 Isonomia与评议会
第二章 伊奥尼亚自然哲学的背景
1 自然哲学与伦理
2 希波克拉底
3 希罗多德
4 荷马
5 赫西奥德
第三章 伊奥尼亚自然哲学的特质
1 宗教批判
2 运动的物质
3 制作与生成
第四章 伊奥尼亚没落后的思想
1 毕达哥拉斯
2 赫拉克利特
3 巴门尼德
4 埃利亚学派之后
第五章 雅典帝国与苏格拉底
1 雅典帝国与民主政
2 智者与辩论的支配
3 苏格拉底审判
4 苏格拉底的谜
5 灵机
6 苏格拉底的问答方法
7 柏拉图与毕达哥拉斯
8 哲学王
9 Isonomia与哲学王
附录 从《世界史的构造》到《哲学的起源》
古代希腊史年表
译后记
《柄谷行人文集》编后记