作为公共事务治理主体的政府是由相互依存、相互作用的纵横交错的各个部分组成的复杂系统。从某种意义上说，政府治理公共事务的过程也就是政府组织内部各部分处理相互关系的过程。政府组织内部各部分之间的关系状况直接影响着政府组织整体性功能的发挥程度和公共事务治理的绩效。协同论中蕴含着系统内各子系统相互协调合作，使系统呈现有序状态，实现系统整体效应的思想，这对处理政府组织内各部分之间的关系，实现政府整体功能具有重要理论价值。因此，文章选取协同论作为主要理论切入点，将协同思想引入政府组织研究之中，运用协同论中的概念和分析范式研究政府组织协同问题，以求能够优化政府组织内部各部分之间的关系，提高政府组织协同性。
《当代中国政府组织协同问题研究》首先介绍阐释了研究政府组织协同问题的相关理论。系统理论把复杂体系都看成是一个系统，并且认为系统具有整体性、关联性、层次性、开放性等特点。协同论主要是研究在各种不同类型的系统内，以自组织为基础，在序参量和相关变量的作用下，各子系统从无序状态转向有序状态，实现系统整体效应和协同效应的理论。协同论和系统理论能够为研究政府组织协同问题提供方法论的指导。治理理论和组织间网络理论强调的治理结构多元化、主体间平等协商、沟通合作的思想则为处理政府组织关系问题提供了有益的分析视角。
以上述理论为基础，本文构建了政府组织协同的解释框架。概念是框架构建的起点，第二章首先界定了协同以及政府组织协同等概念的含义。政府组织协同是指政府组织系统内部各部门之间、各层级政府之间以及政府过程的各个环节之间相互协调与配合，形成井然有序的组织结构，呈现政府的整体功能，实现政府效能最大化的过程或状态。其次阐释了协同论与政府组织的契合性。一方面，协同论具有普遍性和政府组织是一个复杂的开放系统，因此政府组织研究引入协同论具有可能性；另一方面，从理论和现实两个层面论证了政府组织研究引入协同论的必要性。接着分析了影响政府组织协同的相关变量。政府组织结构、职能结构、权力结构等政府结构是影响政府组织协同的序参量（主导性变量）。政府利益、组织文化、组织目标等也会影响政府组织的协同程度。最后总结了政府组织协同的意义或者说协同效应。政府组织协同有利于提高政府公共性，促进“行政区经济”向“经济区经济”转变，实现公共服务供给的高质高效等。
接下来，本文主要从影响政府组织协同的序参量也就是政府结构的角度分析英法德日美五个国家在提高政府组织协同性方面的制度设计，如在政府间结构上大都具有较为合理的组织结构、政府间适度均衡的权力结构、比较明晰的政府间职能结构；政府部门结构设置一般采取职能有机统一的大部门体制，合理有效的部门间协调机构等。对于这些制度设计，我们要以实事求是的态度，进行合理的吸收与借鉴。
建国以来围绕政府结构我国对政府组织进行了多次的调整与改革，逐渐理顺了政府组织间的关系，很大程度上提高了政府组织协同性。纵向政府间从中央高度集权逐步合理向地方放权，地方自主性得到很大提高；地方政府横向间从计划体制下的相互隔绝走向更多的联系和合作；政府职能部门间从传统体制下的部门林立、职责交叉、“精简一膨胀”循环逐步走向精简统一、权责明确。第四章以建国以来的历史为背景，从政府结构着手分析政府组织改革和调整的过程，并作出一定的归纳与总结。
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