悉数予以否决。少数议员主张让陆一试，其理由为：陆在参议院的演说，系说明提出阁员的理由，并非发表政见；当前局势有政府总比无政府好，陆组阁还未成，未经考验，无从分别其好坏；陆叙其生平不赌博不做生意，正见其人不矫饰不欺人；即使陆不擅长演说，亦不见得不能担任总理；陆在参议院获得74张同意票，今若仅因一席谈话便推翻其总理，则当日之74张同意票岂非盲举。
但是参议院最终还是把陆所提的6位阁员名单全部否决。陆征祥还未过国务总理的瘾便先尝到当总唐绍仪组阁时，原以混合各党派的内阁相号召，结果闹得如此分歧，于是大家认为混合多党派的内阁不是好办法，应该组织政党内阁，如英国式。6月21日，同盟会、共和党、统一共和党三党党员举行联合会，以交换唐去后对新阁组织的意见。同盟会坚持要求组织一个政党内阁，共和党则主张超党派的超然内阁，统一共和党赞成超然内阁却反对共和党所提"国务总理必举总统信任者"。这个联合会意见完全不能一致。同盟会乃推派代表晋谒袁世凯，申述对新阁意见，建议组织政党内阁，绝不参加混合内阁，而袁此时已不把同盟会的意见当成一回事了，他已决心要陆征祥为国务总理了。
6月28日，同盟会举行职员会讨论组织内阁问题。蔡元培提议同盟会各国务员应全行退职，以示本会主张纯粹政党内阁之意见。而刘揆一首先反对，他说同盟会在北京已属势力薄弱，若国务员退出则将来内阁消息亦难闻问，前途殊多滞碍。宋教仁则坚决主张"纯粹政党内阁"。
最后，会议同意了宋教仁提出的由陆征祥出任国务总理的建议。
陆征祥，字子欣，上海人，曾为广方言馆毕业生，嗣奉调出洋，为历任公使所倚重，不数年擢升参赞，继充荷兰公使，又继任海牙和平会专使。至民国第一次组阁，因他是外交熟手，遂召他回国，令为外交总长。陆性平和，且无一定的党派，因此老袁令他继任。这时候的参议院中，议长林森回籍，副议长王正廷、署理工商次长两人统已出院，乃改举奉天吴景濂为议长，湖北汤化龙为副议长。议员数十人，然却分作好几个党派。
陆征祥的内阁是个"超然内阁"，按袁世凯的话说是既不属于袁系，也不是同盟会或君主立宪派。
陆征祥的内阁中有四个部的总长获得连任。为：外交陆征祥兼，内务赵秉钧，陆军段祺瑞，海军刘冠雄。由于这4名阁员连任，所以不提交参议院征求同意。提交参议院的另外6个新阁员名单是：财政总长周自齐，司法总长章宗祥，教育总长孙毓筠，农林总长王人文，交通总长胡惟德，工商总长沈秉坤。
7月18日，陆征祥经参议院以74票通过其出任总理。
7月19日，参议院投票表决陆所提的阁员同意案时，多数议员们竟以不信任总理而理的苦头，只好称病住进医院。
参议院否决了陆内阁新阁员名单后，同盟会的议员们认为袁世凯的“超然内阁”路线走不通，于是大家又唱出“政党责任内阁”。拥宋主张，并由宋教仁组阁，亦有主张由黎元洪组阁的，还有一派主张由蔡锷组阁，因蔡是统一共和党人，而其主张又和共和党接近。同盟会对蔡亦引为同志，蔡锷出来组阁，同盟会和统一共和党都会全力支持，共和党亦无从反对。
而参议院中部分议员亦认为应该委曲求全，其他如孙毓筠则认为总统可以解散参议院，与其无政府，不如无参议院，北京各报亦赞成孙的提议。
章炳麟、张绍曾、孙毓筠、王赓等亦致电武昌的黎元洪，表示对议会的反感。
袁世凯见否定了6名阁员，很是生气，其密令武昌军界首领前鄂第四镇统制邓玉麟、军务部长阎鸿飞、军政府军咨官方兴等，联名致函参议院。对参议院的行为公开指责。同时，拿出他的法宝——北洋军。其密令北京军警联合会发表通电，骂参议院议员“挟持党见，故作艰难，破坏大局”。袁还招待全体议员，宣布国际间的危机以及无政府的危险。这时出现了许多奇奇怪怪的通电和传单，有说要杀议长吴景濂及谷钟秀的，有说要用炸弹对付议员的，有说军警要暴动的，吓得许多寄居财政学堂的参议员们竞偷偷地搬了出去，同时不敢出席参议院。
北京军警联合会议除了发表公开电而外，还召开特别会议，会场中情绪甚为激烈，认为参议院误国，应用武力解决之，最后决议：(一)请大总统再规劝参议院；(二)公推代表往谒陆总理，请其打消辞意；(三)如参议院仍顽固不化，仍不投同意票，则请大总统解散参议院。最后还发表了一项声明，说是明知军警不应干涉政治，但为了国家前途不得不出此。第二天，军警代表40余人趋赴国务院谒陆。军警代表余大鸿道：“当前外交危急，非总理维持不可，外问虽有阻力，但请总理千万不可求去，这是我们军警界全体的意思。本来我们军警界并不想干预政治，不过我们亦是国民一分子，国家到了如此地步，我们出于国民天职，不能不有此一来，何况南北之能达到统一，就是由于南北军人以国家为前提，不忍兵戎相见，使国家纷乱，同胞受苦。今天如果总理一去，国事瓦解，外患相侵，战祸必不能免，所以我们才来见总理，请你打消辞意。”
陆征祥道：“我在外国多年，还没有见到军人对国务员有如此的诚恳和善意，使我不仅感激，而且十二分感动。今后无论如何必将尽全力服务，即使牺牲名誉，牺牲地位，牺牲性命亦在不惜。请各位把我的意思转达全体军警界的同人，我非常谢谢。”
在参议院第二次投票同意陆阁阁员之前，北洋军系的毅军总统姜桂题、直隶提督马金叙、执法处长陆建章、拱卫军司令官段芝贵4人，约请同盟会会员陈策，在安庆会馆宴请参议员，并有新闻记者和政界人士参加。
宴会临到尾声时，有一个名不见经传的新闻记者陈绍唐，突然站起身来大声吼叫说：“明天不通过补充阁员名单，即当宣布议员死刑，勿谓言之不预！”
7月26日，袁世凯再以咨文给参议院，谓：“前次提出六员，既经贵院否决，兹特重行遴选，拟任周学熙为财政总长，许世英为司法总长，范源濂为教育总长，陈振先为农林总长，蒋作宾为工商总长，朱启钤为交通总长，依照《临时约法》第三十四条咨请贵院同意。”
这个咨文事先很秘密，提交参议院后，只有工商总长蒋作宾未获通过，改由刘揆一递补，获得参议院同意。至此，僵持了整整一个月的无政府状态乃告结束。
以上6人，周、许、朱三人都是北洋派旧官僚，范是君主立宪派，陈、刘二人都是同盟会会员。同盟会本已约束全体会员不得参加新内阁，可是有人硬要过总长的瘾，不受约束，同盟会也只好听之任之。
这出文武合璧的连台好戏，是民国成立以来北洋军阀使用武力威胁议会的第一炮。但是，同盟会和参议院人士，都认为这件事情没有什么了不起，为了保持南北统一，为了避免列强干涉，都应当容忍下去。正由于同盟会采取了这种大量容人的态度，使得袁步步专权，得寸进尺。
这时，袁世凯发布了各省都督名单，为：黎元洪兼湖北都督，谭延闽为湖南都督，孙道仁为福建都督，朱瑞为浙江都督，李烈钧为江西都督，尹昌衡为四川都督，张凤翔为陕西都督，胡汉民为广东都督，陆荣廷为广西都督，冯国璋为直隶都督，赵尔巽为奉天都督，陈照常为吉林都督，宋小濂为黑龙江都督，程德全为江苏都督，柏文蔚为安徽都督，周自齐为山东都督，张镇芳为河南都督，阎锡山为山西都督，赵惟熙为甘肃都督，杨增新为新疆都督，蔡锷为云南都督，唐继尧为贵州都督。
同时在总统府内设立财政会议，每星期一开会一次，由袁世凯亲自主持，出席会议的几乎全部和借款事有关联，计为：梁士诒、叶恭绰、梁如浩、胡惟德、施愚、熊希龄、周学熙、赵秉钧。
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