本次整理点校，以安徽人民出版社1959年线装排印本为底本，以中国中医药出版社1997年排印本《中国医学大成》第8册内的《程杏轩医案》为对校本（简称医学大成本）。在整理过程中，采取的具体方法和原则是：
1.统一目录。底本存在着的少数正文标题与书前目录不一致的地方，现统一目录，使正文标题与书前目录一致。
2.繁体字改为规范的简化字。但人名、地名中的繁体字如会产生误解，则仍保留原貌，不加改动。
3.底本中属笔画小误的错字，径改。如“日”误作“日”，“已”误作“己”，“大”误作“太”之类，均予径改
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