《桂林古本伤寒杂病论》共16卷，内容涵盖伤寒、温病、暑病、热病、湿病、燥病等病证的脉证与治疗，以及太阳病、阳明病、少阳病、太阴病、少阴病、厥阴病的辨证论治。此外，还包括对霍乱病、痉病、阴阳易差病的治疗，以及不可发汗病、可发汗病、不可吐病、不可下病、可下病的辨证与治疗方略，以及发汗吐下后病脉证的治疗。

卷第一
平脉法第一

卷第二
平脉法第二

卷第三
伤寒例第三

卷第四
辨温病脉证并治第四

卷第五
辨暑病脉证并治第五
辨热病脉证并治第六
辨湿病脉证并治第七
辨燥病脉证并治第七

卷第六
辨太阳病脉证并治上

卷第七
辨太阳病脉证并治中

卷第八
辨太阳病脉证并治下

卷第九
辨阳明病脉证并治

卷第十
辨少阳病脉证并治
辨太隂病脉证并治

卷第十一
辨少隂病脉证并治
辨厥隂病脉证并治

卷第十二
辨霍乱病脉证并治
辨痉隂阳易差脉证并治

卷第十三
辨不可发汗病脉证并治
辨可发汗病脉证并治

卷第十四
辨发汗后病脉证并治
辨不可吐

卷第十五
辨不可下病脉证并治
辨可下病脉证并治

卷第十六
辨发汗吐下后病脉发并治