常熟境内区域划分始见于唐，历经数次调整。民国18年8月，县以下实行区乡制，百户以上村庄为乡，百户以上街市为镇，最多时全县设260个乡镇。1949年4月常熟解放后，县域设有7个区57个乡镇，后因常熟与邻县边界多次变动，有部分乡镇（公社）和村先后划给太仓、昆山、无锡、江阴等县和新建的沙洲县。至1962年底，常熟与邻县边界调整基本结束。当时全县划分为2个镇、32个公社、1个林场。改革开放以来，根据经济建设和社会发展的需要，在1983年撤县建市和“八五”期间全市撤乡建镇的基础上，又多次对行政区划进行调整。至2005年底，常熟市设建制镇10个，林场1个，行政村231个，居委会134个。另有国家级和省级开发区各1个，省级招商城1个。
1992年，城区周边的琴南乡、城郊乡并入虞山镇 1999年6月，常熟市对沿江9个镇实施了行政区划的凋整，撤销梅李、赵市、珍门三镇建制，以原三镇行政区域设立梅李镇；撤销王市、福山、周行三镇建制，以原三镇行政区域设立海虞镇；撤销碧溪、浒浦、吴市三镇建制，以原三镇行政区域设立新港镇。2000年6月，藕渠镇、兴隆镇井入虞山镇。2003年，先后有21个建制镇的行政区划进行了调整。
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