分六化，每化为一卷，即道化、术化、德化、仁化、食化、俭化。每化又分若干章，共一百一十章。主要运用道教哲学思想和儒学伦理观念，以类推比附的手法，从事物的变化中，阐述修道成仙的思想，探寻社会治乱的因由，指出实现太平治世的道路。
《化书》本齐物以言“道化”，本虚无以言“术化”，本无为以言“德化”，本道德以言“仁化”，本税多民饥以言“食化”，三宝之一为俭，本之以言“俭化”。每化多先例举自然现象如蛇化为龟，雀化为蛤之类，从中分析哲理，以明超生脱死及修身持世之道。此即所谓“君子体物而知身，体身而知道”之意。《道化》、《术化》两卷，主要论出生死、入神化之道，为本体观、自然观；《德化》、《仁化》、《食化》、《俭化》四卷，主要论修身治世之道，属政治观、伦理观、修养观。
《化书》以“化”为名，以万物变化之道而立论，认为化之不间，如环之无穷，皆出之于道，而以虚无为体。他列举老枫可化为羽人，朽麦可化为蝴蝶，贤女可化为贞石，山蚯可化为百合，有情无情，皆可相互转化。修道之要，唯在师无志虚，无心合道，以神使形。忘形以养气，忘气以养神，忘神以养虚。一有无，一死生，一情性，一内外，无实无虚可与道俱。如此则得天地之纲，知阴阳之房，蜕五行，脱三光，召阴阳，役五行，乃至别构天地，重作日月，无所不化。
其论帝王之道，以道德仁义为本，认为五常之道皆出于一。君有奇智，则天下不臣，有赏罚之教邪道进，有亲疏之分则小人入。唯行仁义中正，能无忧无害。
其论含为民之本、民之急乃至食为五常之本。尚俭均食，则黔黎相悦，仁义自生，天下自治。对使民饥之统治者，则极度力抨击之，认为此乃不平之甚，不义之甚。
其谓守一道，莫过于俭，俭乃救世之要道，理想的政治。
《化书》有关物化顺逆的描述，为道教内丹反还说提供了哲学依据，在中国思想史和内丹理论发展史上有着重要的地位。此后道教将其列为重要教材，与四子真经相提并论。
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