江藩嘉庆间入粤为阮元幕僚，阮元出资刊刻《师承记》，以顾炎武、黄宗羲深入宋儒之室，多骑墙之见，故仅得忝列卷末；后又刊《宋学渊源记》，然不录自诩宗程朱的桐城方苞、刘大櫆、姚鼐。方东树与江藩同在阮元幕府，对此大为不满，故撰《汉学商兑》以驳之。
其书仿朱熹《杂学辨》体例，先摘录原文，复各为辨正于下。其书首先为理学、道学正名；后引戴震、段玉裁、孙星衍等人由小学入义理之说而一一驳斥，认为尚音韵训诂名物制度只是小学内事而非大学，不可由此得义理之真；末取江藩《国朝经师经义目录》有关论述一一辩驳。
书中虽有牵强之处、谩骂之语，且贬汉学家立门户争异同而自不知，辨程朱未堕禅而自多用禅语，但针砭汉学，亦有切中其病者，至于辨阮元师、儒之分，下启近代章太炎、钱穆等人学说，亦不可没其功。
《汉学商兑》道光六年初刻本世所未睹，今所行最早刊本为道光十一年辛卯冬重刊本。后又有同治十年望三益斋刻本、六安求我斋刻本等十余种。此次整理，道光辛卯本为底本，并参校诸本，施以新式标点。
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