马凯同志在两会上对方案做说明时非常强调职能转变。与历次改革方案相比，职能转变的表述表现出本次方案推进政府改革的明确思路和方向。职能转变有四个方面：职能转移、职能下放、职能整合和职能加强，重心放在职能转移。职能转变的核心是三个方面：一是政府向市场转变；一是政府向社会转变；一是中央向地方转变。主线实际就是“撤”“减”和“小”，政府职能在调整过程中能撤就撤、能减就减、能小就小，政府向市场、社会和地方放权和扩权。
因此，此次方案代表了两个调整：一是机构的调整；一是权力的调整。权力调整是有方向的，与历次机构改革很大的不同在于权力走向比较明确。在机构改革方案的10项说明中，前5条都是减少权力。第一是减少和下放投资审批事项；第二是减少和下放生产经营活动审批事项；第三是减少资质资格许可和认定；第四是减少专项转移支付和收费；第五是减少部门职责交叉。改革方案非常明确的一条主线是政府要小，社会要大，“小政府、大社会”的思想贯穿始终。
此次机构改革方案与历次改革的最大不同并不是大部制，将其称为“大部门制改革方案”是错的，应该叫“大社会制改革方案”。改革并不是做大部门，单看某一个部门是变大了，但政府变小了，做大的是社会。职能转变就是缩小政府，社会改革才是此次机构改革的核心和实质，表面看上去是在调整政府职能，在精简机构，实际是放大了社会。
因此，此次机构改革有明确的顶层思路，这也是与历次机构改革方案的最大不同。
其实在改革开放之初的20世纪80年代，就非常明确提出中国的经济改革要朝着“小政府、大社会”方向发展。当时海南建省就是“小政府、大社会”的试验。后来改革进程中出现很多问题，实际并没有走向小政府大社会，在后来的改革实践中，这六个字慢慢消失，人们慢慢习惯了大政府，不光习惯了大政府，还觉得建立大政府恰恰是中国特色之路的应有内容。甚至有的人说，大政府可以办大事，例如可以应对金融危机，应对汶川地震，并向非洲、拉美一些国家推荐我们建立大政府的经验。
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