作者通过问题式的研究发现，隋唐两代整体的佛学系统主要是围绕着缘起说、佛性论、修行成佛的方法与途径三种理论展开的，至于判教、法统等其他理论则处于次一等或辅助性的地位。《隋唐佛学研究》即循此思路，以探索天台、三论、法相、华严、净土、密教、律宗、禅宗等宗派的核心教义，不取赅备无遗。这样的研究既不同于以马克思主义理论研究佛学的传统，也有别于当今盛行的取西方哲学（或史学）的框架来范围佛学的方式，又与“以佛法研究佛法”的努力存在明显的差异，在学术界没有先例。《隋唐佛学研究》篇章结构的安排，在看似承袭旧贯的论述中．重在展示各宗派高僧横向之间的相互争论与融和的佛学风貌。同时，对天台的一念三千、性恶说、无情有性以及法相宗的唯识无境、禅宗的顿悟与渐悟之争等诸问题，兼及隋唐佛学的兴起和衰落之由，均提出自己的一家之言。

引论
一、隋唐佛学繁荣的内在动力：争论与融合
二、隋唐佛学的中心议题：“缘起论”、“佛性论”、“修行成佛的方法与途径”三种理论
三、本书的论述范围
四、关于研究方法的问题

第一章  隋唐佛学兴起的内因与外缘
一、六朝佛学的持续勃兴与人才的聚集
二、外部的条件

第二章  天台智颉的思想理论与实践学说
一、“一念三千”的缘起意
二、佛性说的流变与整合
三、“六即佛”与上观修习

第三章  天台学说的继承
一、灌顶阐述涅佛性思想的理由
二、智威、慧威与玄朗的止观传承

第四章  荆溪湛然与“无情有性”
一、湛然时代的佛教形势
二、“无情有性”说的本质及其影响

第五章  三论宗的“缘起性空”理论
一、罗什以来“性空”学说的传承系统
二、“八不”缘起
三、“草木有佛性”

第六章  法相宗的“缘起”之义
一、唯识所现的“赖耶缘起”
二、“唯识无境”的在含义
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