第二是以人类物质能量代谢活动为主体的经济生态子系统，包括生产、消费、还原、流通和调控五个部分。人类能主动为自身的生存和发展组织有目的的生产、流通、消费、还原和调控活动：人们将自然界的物质和能量变成人类所需要的产品，满足眼前和长远发展的需要，就形成了生产系统。生产规模大了，就会出现交换和流通，包括金融流通、商贸物质流通，以及信息和人员流通，形成流通系统。流通后是消费系统，包括物质的消费，精神的享受，以及固定资产的耗费。最后是还原系统，人类社会的物质总是不断地从有用的东西变成没用的东西，再还原到我们的自然生态系统中去为生态循环所用，也包括我们生病的还原以及人的还原，例如人生病就医，罪犯的劳动改造都是一种还原，让他变好。是调控系统，调控有几种途径，一是政府的行政调控；二是市场的经济调控；三是自然的响应和灾害；自然能通过各种正负反馈来进行强制性调控；四是人的行为和精神调控。这些部分的协同作用就形成了经济生态子系统。
社会的核心是人，人的科技、体制和文化构成社会生态子系统：是人的认知系统，包括哲学、科学、技术等。是体制，由社会组织、法规、政策等形成。是文化，是人在长期进化过程中形成的观念、伦理、信仰和文脉等。三足鼎立，构成社会生态子系统中的核心控制系统。
这些子系统相互之间是相生相克，相辅相成的。工业企业生态研究、规划和管理人员的职责就是要了解每一个子系统内部以及不同子系统之间在时间、空间、数量、结构、秩序方面的生态耦合关系。其中：时间关系包括地质演化、地理变迁、生物进化、文化传承、社会建设和经济发展等不同尺度。空间关系包括大的区域、流域、政域、甚至小街区或村庄。数量关系包括规模、速度、密度、容量、足迹、承载力等量化关系。结构关系包括人口结构、产业结构、景观结构、资源结构、社会结构等。序是很重要的，每个子系统都有它自己的序，包括竞争序，共生序，自生序，再生序和进化序。工业企业可持续发展的关键是辨识与综合三个子系统内部及其相互间在时、空、量、构和序等五个层面的耦合关系。
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