抗战胜利，在大英文化委员会的邀请下，1945年9月，他与孙毓棠、洪谦、沈有鼎诸教授联袂赴英讲学，任牛津大学访问教授，继续钻研蒙古史，并到比利时布鲁塞尔大学和鲁文大学作短期讲学，介绍中国学术文化。1946年冬回国，仍在清华大学任教，在历史系与吴啥、刘崇表等教授一起，分别讲授中外历史课程，担任中国近代史教学任务。他治学严谨，教学认真，很受学生们欢迎。
1948年冬北平解放前夕，国民党当局派要员到北平，劝说i许多著名教授、专家南撤和到台湾，劝说邵循正与他们一起走，遭到邵的拒绝。美国某大学这时也乘机邀他去任教，他也毫不动心，表现了中华民族的凛然骨气。他虽然一向在政治上不是一个活跃人物，与中国共产党也并无接触，但却是一个热爱祖国、富有正义感的学者。凭着自己半生的经历，清楚地认识到国民党的腐败无能，看准了他们对中国前途不会有任何改革和振兴的作为；他更不愿在这个时候离开苦难的祖国逃到太平洋彼岸去寻找桃花源，仰洋人之鼻息。因此他决定留下来，把自己的学问、知识贡献给祖国人民，为祖国培养年轻一代的历史工作者而竭心尽智。
新中国成立后，邵循正继续在清华园内任教，并于1950年出任清华大学历史系主任．1952年院系调整后任北京大学历史系教授、中国近代史教研室主任。从此，他在北大历史系一直工作了二十余个春秋，直到生命的最后一息。
除在北大任教外，邵循正还同时受聘为中国科学院近代史研究所研究员，于1952年至1958年兼任近代史研究所帝国主义侵华史、政治史两个组的组长，担任中国史学会主编的《中国近代史数据丛刊》的编辑委员。
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