社会经济系统中的人常常为了共同的目标在一起生活、工作，他们之间经常进行信息、经验、感情等各方面的交流。每个人的思想、行为，特别是那些举足轻重的成员对其他成员可能产生重要影响，以至于影响到群体的行为。在社会经济系统中，成员之间的交互作用非常复杂，而且这种交互作用及其结果是一种非线性关系，在宏观上，会出现涨落，并涌现出复杂的系统行为。这些特征使得社会经济系统中的主体具有记忆、学习和产生对策的能力，具有高智能性和适应性。通常，这种智能程度越高、适应能力越强、行为的不确定性越大，系统就越复杂。
此外，主体活动的复杂性并不能完全排除主体行为的偶然性和无序性，因此，一方面，社会经济系统会呈现出极大的随机性、模糊性和不稳定性，另一方面，社会系统又会表现出一定的秩序性、确定性、必然性和规律性。我们看到，一些地区为了经济发展，仅仅将自然作为一个认识、征服、改造、支配的纯粹与人无关的对象，却没有注意到社会经济系统的复杂性，结果事与愿违，对环境造成极大破坏，得不偿失，这一现象已引起研究者注意。目前，整个社会科学都在越来越多地关注个体的主动性，并把它作为观察与研究社会经济系统的基本出发点。
2）结构的复杂性
在社会经济系统中，既有人的要素，又有物的要素和信息的要素，如：经济、政治、科技、文化、教育、宗教、艺术等诸多因素，是一个人流、物流和信息流的动态集合体。实际上，社会经济系统演化发展是各种要素交互作用的结果。社会经济系统的结构通常是一种层次或网络结构，往往涉及信息流的结构、工作任务流的结构、资源分配流的结构等等。主体和系统其他要素之间通过这些系统结构联系在一起。所有联系的总和把社会经济系统要素关联成一个整体，形成特定的、动态的复杂网络结构形态。通常，系统和子系统的结构会随社会经济系统的演化而变化。
3）要素间相互作用的复杂性
在社会经济系统中，除了作为社会现象、社会关系、社会运动、社会规律的载体和附属物的客观存在物外，更为重要的是这些实物背后存在的社会关系、结构和规律，如：生产力、生产关系、人类社会发展的总规律、特殊社会形态发展的规律等等。这些抽象关系物，就像物理学中的“场”一样看不见和摸不着，但它确确实实存在着，是不以人的主观意志为转移的（王昭风，2005）。这种存在于社会经济系统中的关系和结构是动态的，随着时空演化，它们之间的运动不断推动着人类社会向前发展。
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