阿克塞哈萨克族自治县位于甘肃河西走廊西端，东接肃北蒙古族自治县，北靠敦煌市，西与新疆维吾尔自治区境内的库木塔格沙漠相邻，南依塞什腾山与青海省为邻。甘青藏公路穿越县境南北。 阿克塞哈萨克族自治县总面积3．34万平方公里，约占全省总面积的8． 56％，其中耕地占0．01％，天然草场占29．56％，林地占0．09％，荒地沙漠占68．22％，城镇占1．56％，河流、湖泊占0．56％。 境内山大沟深，地形复杂。全县地形狭长，东西长425公里，南北宽125 公里。东南高而西北低。海拔1500米至5798米，平均海拔3200米左右。阿尔金山、党河南山与塞什腾山之间（苏干湖盆地）广布戈壁沙漠，高原盆地苏干湖地表平坦，海拔2800米～3000米。 境内祁连山西向余脉与阿尔金山东向余脉连成一片，纵贯全境。阿尔金山、党河南山、塞什腾山、土尔根达板山、野牛脊山等5条山脉呈西北一东南走向环绕全县。这些高山峻岭，其雪线以上终年积雪，现代冰川遍布。 境内河流主要有大、小哈尔腾河，安南坝河，青石沟河，均发源于上述高山地带。其他的间歇性（季节性）小溪小河，主要源于上游冰山和高山积雪融水，流程短，渗漏大，水量小。山区还有泉眼，水量丰沛，水质佳。湖泊主要有大、小苏干湖，水源系大、小哈尔腾河，总面积119．6平方公里。其中大苏干湖蓄水量约为1．72亿立方米，属咸水湖；小苏干湖蓄水约为O．24 亿立方米，属淡水湖。 全县气候属青藏高原高寒型农牧业气候区。南部属高寒半干旱气候，北部属温带干旱气候。荒漠化气候特点明显。干旱少雨，四季和早晚温差大，冬长夏短，冰雪常存约9个月。年均气温3．5℃。7月份平均气温为16．7℃ ，1月份平均气温为一10．80C。年降水量120毫米，且分布很不平衡，多集中在5月一9月，6、7、8三个月降水量占全年降水量的72％左右。日照时间长，全年在3000小时以上。日照百分率为34％左右，蒸发量为2500毫米，为降水量的二十多倍。无霜期90天。因地域辽阔，地形复杂，立体气温分布明显，自然灾害频繁，主要有干旱、寒潮、暴风雪、冰雹、霜冻、大风和沙尘暴等。 刚克塞哈萨克族自治县，古属三危地。战国、秦、汉时为月氏、乌孙等部落驻牧地。今阿克塞县的当金山以北地区，汉属西域都护府，三国、西晋时隶属西域长史府，东晋时先后为前凉、前秦、后凉等所辖。北魏时当金山以北属西戎校尉府，以南属吐谷浑；隋时分属鄯善郡、西海郡、敦煌郡；唐时属沙州；宋时为西夏所辖；元时属沙州路。明代设安定卫，今阿克塞县境大部分归其所辖。清初属沙州卫，后沙州改为敦煌县，阿克塞属安西直隶州。1929年青海建省时，当金山以南归青海，以北属甘肃敦煌县。阿克塞的哈萨克族原驻牧于新疆阿尔泰、哈密和巴里坤一带，因不堪国民党反动派的压迫和剥削，从1929年开始向甘青边境迁移，长期过着流浪生活，主要游牧在阿克塞、安南坝、哈尔腾、海子一带。随着迁入甘肃的哈萨克族的增多，国民党甘肃省政府于1938年在玉门县区地方设立“哈民设治局”（后移址于5K， 门赤金），1941年2月撤销。1942年12月废除了百户制，改以军队编制统治哈萨克族。1944年，甘青新三省会议议定鱼儿红、玉门、安西、敦煌南山一带为哈萨克族牧民的居住和放牧地。除1946年部分返回新疆外，留在阿克塞地区的哈萨克族四处漂泊，历经沧桑，直至新中国成立。1951年1月，人民政府在敦煌设立了“安置流散哈萨克族工作委员会”，5月，人民政府驻阿克塞地区的工作组由海子转移到前山的博罗转井，哈萨克族牧民也随后搬往前山，逐渐安定下来。1953年3月底到4月初，中共中央西北局和西北行政委员会在兰州召开了“甘、青、新边境哈萨克族头人联谊会暨各族团结会”，并拟定了《甘、青、新边境各民族代表关于加强民族团结，安置边境哈萨克族的协议意见》，规定“以花海子（色勒屯）为中心，东至哈尔腾东端的托逊堡、西至安南坝，南至海子的南端，北至燕都尔士（现燕丹图）的地区为哈萨克族居住和放牧的区域”。从此，甘肃境内的哈萨克族人民彻底结束了长期以来漂泊流浪的生活。1954年4月26日，阿克塞哈萨克族自治区（县级）正式成立，县府设在博罗转井。 阿克塞县以县城西十多里处的阿克塞沟而得名，“阿克塞”系哈萨克语 “纯洁”的意思。1998年9月，县城迁至自然条件较为优越的红柳湾镇。现在全县辖2乡1镇，10个行政村。
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