高耗能、高污染的产业结构使经济发展对生态环境构成巨大冲击，作为地球生物圈重要组成部分的水生生态系统也受到了严重影响。一些江河湖海水域富营养化严重，赤潮、水华频发导致鱼类产卵场、索饵场缩小、外移，甚至消失；浅海、滩涂、湖泊的增养殖水域环境质量下降，水域污染事故增多，养殖生物病害频发，养殖产品质量安全风险加大。水域生态功能退化和环境质量下降已成为制约中国渔业可持续健康发展的瓶颈。
　　刘晴、徐跑主编的《渔业环境评价与生态修复》围绕生物指示在环境监测中的应用、产地环境评价与质量控制技术、重大工程对渔业生态的影响、水域环境调控与修复、气候对渔业生态安全的影响等5个专题开展广泛的研讨与交流。

Controlling harmful cyanobacterial blooms in a world experiencing anthropogenic and climatically—induced change
Contamination by legacy and emerging Pops in the Asia-Pacific region
Chemical and biological environmental agents and quality relegation of fishery products
The ACIAR—BFAR Rinconada Lakes project：improving fish culture practices for sustainability and profitability
渔业遥感应用研究
西北印度洋大眼金枪鱼环境因子空间叠加渔场预报模型与模块开发
Immobilized microorganism method purifying the harmful substances to fish
海洋、海岸工程对海洋渔业生物资源影响及其损害评价有关问题的分析与探讨
2004—2009年渤海湾（天津区域）鱼虾贝产卵场水质环境综合评价
大型底栖动物污染指数（MPI）评价海岛潮间带环境
我国海洋滩涂贝类养殖产地环境监测和评价研究
海水滩涂贝类养殖环境质量的评价方法
洄游性鱼类耳石中锶、钙元素的环境“指纹”特征
鱼类软组织中微量元素的生物存在和积累
基于WebGIS的大洋渔业信息服务系统
杭州湾滩涂湿地鱼类种类组成和多样性的季节变化
黄河干流甘肃段渔业资源现状与保护研究
象山港养殖水域光谱特征测量与分析
2009年莱州湾海域水质营养盐特征及年际变化规律研究
冬眠期氨暴露对中华鳖幼鳖部分组织学特性的影响
大肠杆菌和粪肠球菌感染对虾夷扇贝免疫酶活性的影响
不同饲料及投喂频率对星斑川鲽幼鱼生长和养殖水环境的影响
环境因子对链状亚历山大藻生长的影响
气候变化与渔业：影响和对策
大型湖泊对气候变化的响应
不同品种的鱼苗对凤眼莲生长影响的试验
人工鱼礁礁体阻力系数的模型实验研究
渤海中国对虾、三疣梭子蟹、海蜇放流状况与效果
黄浦江上游渔业资源增殖放流效果评价
渤海莱洲湾梭子蟹放流海域生态特征研究
人工湿地处理海水养殖外排水影响因素及其效果分析
生物操控技术在景观水体生态修复中的应用
深水网箱内养殖水环境物理修复研究
Prevention of luminous disease of prawns by Vibro harveyi using ecological technology
Correlations between detachment of abalone larvae from plates and the change in community structures of benthic diatoms
中国银鱼的研究现状及展望
异育银鲫体外肝细胞损伤模型的建立及甘草多糖的保肝作用
淡水蚌体内活性物质的研究进展
天然海域渔业生物种质资源经济价值评估
中国4个地理群体中华鳖基于线粒体DNA控制区基因片段序列的比较分析
中华绒螯蟹生物学及群体判别的研究进展
6个克氏原鳌虾种群形态差异的分析
基于理论模型法测量单室鳔和两室鳔鱼类目标强度
椭圆背角无齿蚌基因组DNA提取的方法比较
鲇体色POMC基因的克隆与表达分析
3种禁用药物标准液稳定性试验