本教材第1章为绪论，第2章有机污染物微生物降解和转化的原理及途径、第3章水污染和水生态治理微生物技术、第4章大气污染物的微生物处理技术、第5章固体废物处理处置微生物技术、第6章土壤污染的微生物治理技术、第9章PcR技术和高通量测序技术在环境工程中的应用、第10章功能基因工程菌的构建及应用。同时，又增加了一些前沿内容，如第7章抗生素和抗性基因和第8章碳中和与环境微生物技术，以及其他章节的短程反硝化微生物技术、黑臭水体微生物处理技术、塑料的微生物降解技术、高通量测序技术等。
本教材可供高等院校环境工程、生态工程专业老师和学生以及行业工作者使用，可作为环境工程微生物学、环境微生物技术等课程的专用教材，也可作为水污染控制工程、固体废物处理工程、生产实习、毕业实习、毕业设计（论文）等课程的教学参考书，是一本产教融合教材。

第1章 绪论
1.1 环境生物技术概论
1.2 环境生物技术的发展
习题
第2章 有机污染物微生物降解和转化的原理及途径
2.1 微生物代谢的方式、原理和基本过程
2.2 烃类的微生物降解途径
2.3 烃类衍生物的微生物降解途径
2.4 有机金属化合物的微生物降解途径
习题
第3章 水污染和水生态治理微生物技术
3.1 水体脱氮微生物技术
3.2 短程反硝化技术
3.3 水体脱磷微生物技术
3.4 微生物絮凝剂
3.5 微生物膜及其固定化
3.6 黑臭水体微生物处理技术
3.7 受损河流和湖泊的生物修复技术
3.8 受损海洋生态系统的生物修复技术
习题
第4章 大气污染物的微生物处理技术
4.1 废气生物处理技术的研究现状
4.2 废气生物处理的原理和工艺
4.3 有机废气的生物处理
4.4 无机废气的微生物处理
习题
第5章 固体废物处理处置微生物技术
5.1 厨余垃圾的微生物处理技术
5.2 畜禽粪污的微生物处理技术
5.3 塑料的微生物降解技术
5.4 秸秆等农业固体废物的微生物降解技术
习题
第6章 土壤污染的微生物治理技术
6.1 土壤有机物污染的微生物治理技术
6.2 土壤无机物污染的微生物治理技术
习题
第7章 抗生素和抗性基因
7.1 抗生素的环境危害
7.2 抗性基因及其产生原因
7.3 环境抗性基因的工程处理技术
习题
第8章 碳中和与环境微生物技术
8.1 固碳微生物种类和固碳途径
8.2 水体中固碳微生物
8.3 陆地生态系统固碳微生物
8.4 岩溶碳汇与微生物技术
习题
第9章 PCR技术和高通量测序技术在环境工程中的应用
9.1 聚合酶链式反应技术原理
9.2 基因测序技术
9.3 PCR及高通量测序技术的应用
9.4 碳氮磷循环功能基因测序技术及其应用
习题
第10章 功能基因工程菌的构建及应用
10.1 功能基因微生物的筛选
10.2 功能基因的提取和分析
10.3 功能基因微生物处理效率强化
10.4 功能基因工程菌的构建
10.5 功能基因工程菌的处理效率验
10.6 基因工程菌的应用案例
习题
参考文献