《研经言》是莫氏研究中医古典医著的心得集，共一百五十余篇。所论内容丰富，涉及面广，对中医的主要经典著作，如《内经》、《难经》、《伤寒》、《金匮》、《脉经》、《千金》、《外台》及明清温热学说等均有论述。
《经方例释》阐发《伤寒论》《金匮要略》经方之奥旨，分上、中、下三部分，共列方剂340首，其内容丰富，引证资料广博，集各家用药之精华。书后并有附录一卷，所载为《伤寒》《金匮》缺方及逸方。本书对于经方的临床应用与研究，具有较高临床实用价值。
《神农本经校注》是清末时期研究《神农本草经》有特色的一部专著。全书共收录365种《神农本草经》药物，上卷120种，中卷120种，下卷125种。《神农本经校注》综合了明清两代名家辑本及名家校本，勘定《神农本草经》正文，并案语其下。又附41种药物的专题论述，包括形态、与相近药物的鉴别、释名、使用特点等。由于莫氏擅长训诂之学，对药名文字的形、声、义训释结合紧密，同时还吸收了方言与民俗相结合的训诂方法，对本草的文字学及地域性特征研究具有重要意义。
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