王廷华，医学博士，留法博士后，教授，教育部新世纪优秀人才，享受国务院政府特殊津贴，四川大学特聘教授，生物治疗国家重点实验室博士生导师，昆明医科大学实验动物学部主任（兼），神经科学研究所所长。现任世界中医药联合会中国综合医院委员会副主任委员，中国研究型医院神经再生与修复委员会常委，中国解剖学会理事，神经解剖专业委员会委员。主持国家级、省部级等20余个项目，获中华医学三等奖1项，省部级自然科学与科技进步二等奖4项、三等奖5项，主编著作23部、教材4部，教育部长江学者评审专家，Ibrain英文杂志主编。在国际高水平学术期刊Nature Communication等发表英文论文203篇(通信181篇），中文论文400余篇；获授权专利11项。

熊柳林，四川大学华西临床医学与澳大利亚南澳大学双博士，教授/副主任医师，研究生导师，省优青，省高校类器官创新团队带头人，Ibrain杂志编辑部副主任。主要从事临床麻醉学/新生儿脑瘫及干细胞治疗临床基础研究，主持国家自然科学基金2项、省部级等5项。在国际高水平学术期刊Nature Communication等发表论文30余篇，主编学术著作4部、教材4部。获中华医学科技奖、省科学技术进步奖、省自然科学奖、中国中西医结合学会心血管病专业委员会科学技术奖等4项，获发明专利1项、实用新型专利3项。现为中国研究型医院学会神经再生与修复专业委员会青年委员，3次应邀在国际大会作学术报告。         

 

鉴于广大临床数据研究人员对编程语言不熟悉，或不能灵活使用编程语言进行临床数据提取，本书详细讲解了基于Python的临床数据提取技术，力求包含数据提取过程涉及的知识点与技能点，同时也给出了一些翔实的例子及程序，方便临床数据研究人员直接将其运用于日常工作中。

第1章 Python基础
1.1 Python简介
1.2 配置开发环境
1.3 第一个程序——Hello World
1.4 数据操作
1.5 控制语句
1.6 算法与业务流程
1.7 模块化
1.8 面向对象编程
1.9 异常处理
1.10 文件I
1.11 API文档的使用
1.12 小结
第2章 相关类库
2.1 OS操作文件及目录
2.2 python-docx
2.3 openpyxl
2.4 正则表达式
2.5 numpy
2.6 pandas
2.7 scrapy
第3章 从Word提取临床数据
3.1 基本资料
3.2 住院信息
3.3 出入院诊断
3.4 既往史
3.5 体格检查
3.6 病程记录
3.7 医嘱记录
3.8 生化检查
3.9 影像学检查
3.10 从视频中均匀提取图片
3.11 小结
第4章 将提取的数据导出到Excel表
4.1 公共方法
4.2 基本信息
4.3 人院诊断
4.4 既往史
4.5 体格检查
4.6 病程记录
4.7 医嘱记录
4.8 生化检查
4.9 小结
第5章 数据清洗及变换
5.1 发现异常数据
5.2 对数字进行修复
5.3 对日期进行修复
5.4 将日期转换为季节
5.5 数据分组
5.6 统一单位
5.7 去除重复数据
5.8 拆分列
5.9 列间的数值计算
5.10 非正态数据到正态数据的变换
5.11 小结
第6章 疼痛病数据提取实例
6.1 原始数据情况及提取思路
6.2 将5张医嘱表的数据纵向合并为1张
6.3 从手术表提取住院时长
6.4 从评分表提取诊断信息
6.5 从手术表提取手术信息
6.6 从检查表提取检查项
6.7 从医嘱表提取长期西药
6.8 从医嘱表提取6个重要医嘱
6.9 从医嘱表提取护理记录与饮食记录
6.10 整理提取的护理记录
6.11 整理提取的饮食记录
6.12 计算当天疼痛评分
6.13 计算出院前疼痛评分
6.14 计算术后3天疼痛评分
6.15 合并相同的手术并计算手术种类
第7章 从HTML提取临床数据
7.1 病程记录的提取
7.2 检查的提取
7.3 生化指标的提取
7.4 医嘱护理的提取
7.5 医嘱药品的提取
7.6 医嘱说明的提取
7.7 医嘱其他的提取
7.8 出院诊断的提取
7.9 补充诊断的提取
第8章 数据分析
8.1 统计描述
8.2 正态性检验
8.3 方差齐性检验
8.4 t检验
8.5 Z检验
8.6 方差分析
8.7 x2检验分析
8.8 非参数秩和检验
8.9 相关性分析
8.10 线性回归
8.11 Logistic回归