《稻种起源演化》以百变稻米的直叙形式开头，叙述了世界稻种的多样性、中国稻种遗传的多样性、栽培稻种的进化演变、栽培稻起源中心、稻种传播途径、水稻品种改良、转基因水稻的重大意义、稻种基因组学的国家安全性等不同内容。全书共分为八章，综述了稻种起源演变进化的许多代表性学术成果与理论观点，特别是综述了21世纪初的普通野生稻分子标记的多样性研究、稻种DNA测序的基因组学研究成果。《稻种起源演化》是一本既继承传统研究成果，又反映现代分子遗传学、基因组学研究成果的新的稻种起源演化研究专著，可作为稻作学有关领域学者，农业院校师生，农业生产管理、技术推广人员的重要参考书。

第一章 神奇的稻种
一、百变稻米
二、世界稻种分类
三、野生稻遗传多样性
四、栽培稻品种多样性
五、保护稻种资源多样性的重要意义
第二章 稻种遗传多样性
一、遗传多样性基本概念
二、野生稻种遗传多样性
三、栽培稻种遗传多样性
四、中国稻种遗传多样性保存现况
五、稻种资源保护与创新利用的重大意义
六、栽培稻遗传多样性研究思考
第三章 栽培稻种的进化演变
一、栽培稻种进化研究的重大意义
二、亚洲栽培稻进化研究的历史概述
三、亚洲栽培稻进化研究的发展重点
第四章 栽培稻起源中心的研究成果
一、亚洲栽培稻起源中心学说
二、栽培稻起源中心具备的条件
三、栽培稻起源中心最新研究成果
四、亚洲栽培稻起源地研究的思考
第五章 稻种传播途径
一、稻种传播路线学说
二、稻种传播途径
三、当代中国栽培稻新品种的传播对世界粮食安全之贡献
第六章 水稻品种改良
一、古籍记载的水稻改良史
二、现代水稻品种杂交育种史略
三、水稻品种改良的先进成果
四、水稻品种改良的重大意义
第七章 转基因水稻的重要意义
一、转基因技术概念
二、转基因的重大意义
三、水稻转基因研究的新成果
四、转基因水稻的安全思考
第八章 稻种基因组学的国家安全性
一、人工驯化的亚洲栽培稻种的广泛适应性
二、转基因技术的威力
三、国家利益和人民至上是基因组学研究的底线
四、粮食安全的转基因科技基础
五、加强水稻基因组学研究