《清同治增修万县志校注》特点：
　　版本：本校注以同治五年（1866）刻本《增修万县志》为底本，以乾隆《万县志》、咸丰《万县志》、嘉庆《四川通志》、道光《夔州府志》为参校本。
　　校勘：因此部县志的版本较为简单，先有刻本，后有今人根据刻本而来的影印本或复印本，故本书的版本就显得简单，没有对校的可能。我们的校勘多针对本志中的引用文献，如大量引用了《舆地纪胜》《太平寰宇记》和“旧志”“十三经”等文献资料，将与原文进行对校，并根据原文进行校勘。如遇“衍”“讹”“脱”等，将在注释中予以注明。
　　体例：原文体例不一，点校时尽量还原文本原貌。原文中的单行大字用五号宋体字，原文中双行小字改为单行，除了特别注明之外一律用六号宋体字。
　　行文：古籍刻本的行文习惯与规范与现文不符。为方便今人阅读，采用现今的行文规范进行点校。