第1章 遗传经济学导论:经济行为决策的生物学基础
1.1 引言
1.2 遗传经济学的产生
1.3 遗传经济学研究现状
1.4 遗传经济学研究方法简述
1.5 展望
第2章 DNA、染色体、基因与孟德尔遗传定律
2.1 DNA、染色体和基因
2.2 孟德尔遗传定律
2.3 遗传重组
2.4 中心法则:从基因到蛋白质
第3章 遗传多态性与遗传力
3.1 等位基因、单核苷酸多态性和次等位基因频率
3.2 单基因遗传与多基因遗传
3.3 同型合子、异型合子和连锁不平衡
3.4 广义遗传力与狭义遗传力
3.5 遗传力的多种估计方法
第4章 社会经济行为基因的测度与全基因组关联分析(GWAS)
4.1 GWAS发展背景
4.2 GWAS研究准备和预注册流程
4.3 GWAS统计推断方法
4.4 GWAS统计力
4.5 基因数据的质量控制
4.6 多表型性状的GWAS
4.7 小结
第5章 分子水平量化个体社会经济行为:多基因评分的构建
5.1 多基因评分的概念
5.2 多基因评分的预测力
5.3 共享遗传结构与基因多效性
5.4 遗传相关性与连锁不平衡分数回归
5.5 利用多基因评分进行因果识别
5.6 当前所构建的多基因评分的局限性与研究展望
第6章 最“天然”的随机化实验:孟德尔随机化法
6.1 孟德尔随机化法的起源与发展
6.2 孟德尔随机化法(MR)与随机对照试验(RCT)
6.3 孟德尔随机化法的分类
6.4 孟德尔随机化法中的工具变量
6.5 MR框架下的工具变量估计值和两阶段最小二乘法估计值
6.6 应对基因多效性和人口分层问题
6.7 小结
第7章 尼安德特人、农业革命与人类进化
7.1 智人的伙伴
7.2 尼安德特人与丹尼索瓦人
7.3 选择压力、进化与农业革命
7.4 不同生活方式形成不同的选择压力
7.5 谷物耕种历史对现代人的影响
7.6 拉马克式演化
7.7 生存是一种幸运
第8章 迁移、跨省婚姻与异配优势效应
8.1 研究背景
8.2 人口普查微观数据与研究样本
8.3 实证分析方法
8.4 实证分析结果
8.5 小结
第9章 再议劳动力市场中的“外貌溢价”现象
9.1 研究背景
9.2 文献综述
9.3 数据与变量
9.4 实证策略与模型设定
9.5 基因工具变量的有效性检验
9.6 实证回归结果
9.7 影响机制讨论
9.8 小结
第10章 水稻种植与现代人基因
10.1 研究背景
10.2 水稻种植可能影响人类基因的潜在原因
10.3 研究设计
10.4 结果分析
10.5 为什么水稻种植会选择这些基因
10.6 小结
第11章 PLINK用于遗传经济学分析操作基础Step-By-Step
11.1 PLINK基本操作
11.2 利用PLINK对基因数据进行质量控制
11.3 利用PLINK进行关联分析
第12章 全基因组关联分析(GWAS)Step-By-Step
12.1 处理连锁不平衡
12.2 处理人群分层
12.3 亲缘关系
12.4 包含协变量的GWAS
第13章 GCTA操作基础Step-By-Step
13.1 GCTA安装
13.2 在Windows系统下运行GCTA
13.3 用GCTA计算遗传关系矩阵
13.4 以GRM值为0.025对样本进行修剪
13.5 计算SNP遗传力
第14章 计算多基因评分Step-By-Step
14.1 利用PLINK计算多基因评分
14.2 计算多基因评分的一般步骤及注意事项
14.3 利用PRSice计算多基因评分
第15章 LDSC操作基础Step-By-Step
15.1 连锁不平衡分数
15.2 LDSC安装
15.3 激活LDSC环境
15.4 利用LDSC计算连锁不平衡分数
15.5 利用连锁不平衡分数回归计算遗传力
15.6 利用连锁不平衡分数回归计算遗传相关性
附录 英国生物银行(UK Biobank)数据申请流程
参考文献
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