放苗后的水体消毒应遵循这样的原则：不用或少用；可用可不用，坚决不用；如果虾已发病，必须使用时，应量少、次数多些。
对虾养殖时，在是否用消毒药物进行预防时，有两种截然不同的观点：一种是自始至终都用消毒药物；另一种是不用或尽量不用。对此，笔者赞同后一种观点。
当养殖的对虾处在健康状态时，在其内外环境中存在一个相对稳定的微生物优势种群，组成正常的微生物群，既参与宿主的“生理系统”活动，又能很好地促进有益菌的生长，抑制有害菌的增生，形成抵御致病菌的第一道防线。在正常状态下，虾、微生物和生态环境三者构成一个“动态平衡”，在一定的允忍范围内，此种平衡有相对稳定性，虾不易发病，正常生长。而使用各种消毒剂和抗生素后，不仅将有害的病毒、病菌杀死，也把池中的有益微生物杀死，更何况池中有90%以上是有益微生物。这些有益微生物是维持养殖水体生态平衡、抵御致病菌的“主力军”。使用上述药物后，使水体、虾体表及体内的有益微生物遭破坏，从而降低虾的免疫力，甚至完全失去免疫力，病原体便突破首道“防线”，侵入体内，导致虾发病。
有些养殖户在养虾时，为了预防虾病的发生，往往不加以分析，或不以科学态度听别人介绍，或错误听取经销商的引导，在虾正常生长的情况下，在固定时间内使用各种药物对养殖水体消毒，但虾仍然发病。对此，作为养殖户，必须对各种指导、引导作出科学的分析。
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