全书共分为四卷，分别为经济史研究、闽台历史文化研究、思想文化及其他和方法论笔谈。在卷一至卷三中，作者以其深入细致的微观考察，对明清以来的诸多历史细部专题，进行独具匠心的剖析。同时，对于区域史研究领域的某些热门问题，如《台湾通史》编撰、《闽台儒学史》编撰等，进行了高屋建瓴的宏观审视，提出了一系列全新的论点。当然，作者在全书的撰写与整理过程中，每每透露出对于历史文化研究功利化和庸俗化倾向的担忧，发人深醒。在卷四中，作者针对不同历史学科研究方法论发表自己的见解，深具学术前瞻性和启示性。全书行文流水，研究角度独到，有较高的学术参考价值。