《从“非本体”到“心性本体”：唯识学种子说在中国佛学中的转向》：
　　首先，种子或原型观念是一般认识的基础。章氏哲学在对待世界的本质问题上是持唯心论的，他认为我们只能认识我们意想之中的事物，离开我们的心识，我们一无所知。他说：“宇宙本非实有，要待意想安立为有。若众生意想尽归灭绝，谁知有宇宙者？”没有众生的意想也就没有关于宇宙的认识，所以章氏由此推断：宇宙本非实有，而是心识意想的产物。既然我们只能认识心识中的事物，那么，我们认识的起点是什么呢？ 
　　章氏哲学具有重经验，重实证的特点，因而他认为我们的认识是以心识的经验为出发点的。不过，他对经验的分析是颇具特色的。他认为我们日常所经验到的事物并不是真实的纯粹的经验，而是经过心识加工过的虚妄的经验。章氏说：“正感觉时，惟有光相热相，非有日相火相。日与火者，待意识取境分齐而为之名。故光与热为现象，光上之圆形锐形，亦为现象，而日与火为非现象。”也就是说，人们对日、火等事物的经验其实并不纯粹，更为纯粹的感觉惟有“光相热相”、“圆形锐形”等因素，是心识将这些感觉因素“综合作用”而成日与火的经验。章太炎在诠释庄子“以马喻马之非马，不若以非马喻马之非马”一句时，说：“马非所以命形。形者何邪？惟是句（勾）股曲直诸线种种相状，视觉所得，其界止此，初非于此形色之外，别有马觉。意想分别，方名为马，马为计生之增语，而非拟形之法言。”即是说，人们对马的视觉经验并不纯粹，马的形状是由“句（勾）股曲直诸线种种相状”组成，我们的视觉经验只能感知这些勾股曲直的种种线条。
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引言
一、基本概念界说：“本体论”、“非本”和“心性本体”
二、问题的提出与研究的意义
三、学界研究现状
四、本论文的研究方法、重点难点

第一章 “种子说''的重要概念、思想渊源及其”非本体“立场
第一节 种子的含义及分类
一、种子的含义
二、种子的异名
三、种子的基本分类
第二节 “种子说”的理论渊源
一、烦恼的潜存
二、业力的存续
三、过未无体与非本体的本体论
四、经部的种子说与唯识化
五、本体的魅影
第三节 种子说的“非本体”立场
一、影像的唯识说：唯识学之根基
二、分别自性缘起——种子说非本体的本体诠释
三、分析名相始，排遣名相终一种子说的诠释特色

第二章 “种子说”的第一次中国化转向
第一节 真谛的“一种七现”理论
一、魏晋南北朝佛学转向之大势
二、真谛“一种七现”论的内容
三、笼统与体用——“一种七现”的诠释特色
第二节 《成唯识论》的种子说
一、《成唯识论》“十门分别”的种子说
二、识转变与非本体——“八识现行”论的种子说
第三节 隋唐时期种子说的衰落与心性本体论的兴起
一、《大乘起信论》的心性本体论
二、从种子说到心性本体论的转变

第三章 对中国化佛学的反动——作为批判哲学的内学院“种子说”
第一节 中国佛学“第二次思想革命”的开启
一、表现：近代唯识学的复兴
二、原因：传统世界图景及自我感知的改变
三、本质：意义体系的重建
第二节 内学院的“种子说”及其批判性意义
一、“用”义：欧阳竞无对种子的界定
二、种现缘起说：欧阳竞无的非本体论
三、体用简别与体用笼统：欧阳竞无对传统佛学心性论的批判
四、吕激的种子论及其对“性觉”说的批判——以熊吕争辩为中心的考察
五、真实佛教之真实性：对内学院批判性种子说之检讨

第四章 寺僧佛学在心性论上的融贯路线及理性化趋势——以种子说为中心的考察
第一节 从太虚的“种子说”看其佛学思想的内在张力
一、太虚唯识学的本质主义特征
二、太虚唯识学的时代主义特征
第二节 印顺对“种子说”的理性研究
一、种子说探源
二、唯识学种子说及其与如来藏之关系
三、印顺心性论研究的理性化特征
第三节 “人间佛教”对心性问题的系统整合与现代佛学的开展
一、太虚、印顺对心性问题的系统整合
二、从佛性到人性：''人间佛教“心性论的现代转向

第五章 佛学心性本体论的现代回归——近代学者”种子说“的新趋向
第一节 章 太炎的种子论与本体追求
一、种子与认识的基本结构
二、非本体与真如本体：章 太炎哲学”自己爆炸“的内在张力
第二节 现代新儒家对”种子说“的批判及其对心性本体论的扬弃——以熊十力为中心的考察
一、熊十力对种子说的批判
二、熊十力的本心本体论及其与种子说的矛盾
三、牟宗三、唐君毅对种子说的研究及批判
结语
参考文献