1950年，中央农业部发布《五年良种普及计划》，要求评选地方优良品种，其中金皇后玉米产量最高，经评选后种植面积迅速扩大。在评选玉米优良品种的基础上，1952年科研机构开展玉米品种间杂交工作，玉米育种家首先使用的亲本材料就是金皇后。俗话说：青出于蓝胜于蓝。用金皇后作亲本杂交产生的后代，不仅保持了它的果穗大、籽粒饱、抗病高产等优良种性；还克服了它的不良性状，特别是在生长势、抗逆性以及构成产量的穗、粒、重诸多因素，均表现出良好的趋势。山东省坊子农场最早育成的坊杂2号（金皇后×小粒红），1950年推广面积达200多万亩。之后相继育成了春杂1号（金皇后×华农1号）、凤杂1号（金皇后×白头霜）、淮杂l号（金皇后×二伏糙）、长杂4号（金皇后×土玉米）、百杂4号（七叶糙×金皇后）等优良品种间杂交种，累积种植面积达2500多万亩。
当育种家将培育玉米自交系间杂交种时，首先以金皇后作亲本选育自交系，用它组合了许多优良的玉米双杂交种。如中国农业科学院培育的春杂5号、春杂14号；北京农业大学培育的农大4号、农大7号；河南新乡地区农业科学研究所培育的新双2号等，均有较大的面积推广，增产在20%～30%或更多，我国第一个在生产上应用的玉米单杂交种新单2号，其双亲之一就含有金皇后玉米的血缘。玉米育种家张庆吉、宋秀岭用金皇后与武陟矮玉米杂交，经过5年自交分离，从中选出了矮金525自交系。再用它作父本或母本，与自交系混517杂交，培育成了优良单杂交种新单1号，20世纪60年代种植面积达2000多万亩。其他科研单位培育的优良单杂交种豫农704、郑单l号、忻黄单4号等，它们都是金皇后玉米所产生的优良杂交后代。
山西省忻州地区农业科学研究所培育的金03玉米自交系，是用50个金皇后玉米果穗连续6年（1959-1964年）自交分离选育而成。金03自交系株高2米，叶片宽展，倾斜上举，雄穗发达，花粉量大，千粒重200克左右；配合力高，适应性广，综合性状优良，在中等水肥地亩产200千克以上。1968-1972年，玉米育种家用金03作亲本，先后育成忻黄单2号、忻黄单22号等8个优良玉米杂交种，亩产均在500千克以上。山西省定襄县330亩忻黄单38号，平均亩产700千克。用金03育成玉米单交种晋单3号、晋单5号、晋单9号等，在山西省种植面积超过1000万亩。金03自交系还被许多科研单位作为亲本材料，先后育成了运单1号、同单20、太单13、新单8号、延单4号、鲁单15号等优良玉米双杂交种。1973年3月召开的全国科学大会上，金03获科技改进一等奖。20世纪30年代以来，金皇后玉米的后代遍布中国广袤大地，在玉米生产和人民生活中占有重要位置；尽管玉米生产中采用的基本上已经全是其杂交种，但在高寒山区和丘陵旱地气候条件比较严峻的地区，金皇后仍以高产、优质、抗逆等优点受到农民的欢迎，种植面积每年都保持在50万N100万亩①。
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