《中国菰和菰黑粉菌功能基因组学研究》是一部系统阐述中国菰和菰黑粉菌功能基因组学研究进展的专著。全书共分8章，1-4章主要介绍中国菰和北美沼生菰的驯化、育种、组学和功能基因研究以及中国菰落粒性和类黄酮合成关键基因功能解析、中国菰米发育过程中籽粒着色的分子机制研究；5-8章主要介绍菰黑粉菌交配型位点、菌株分化与菌丝交配、内切葡聚糖酶、丝裂原活化蛋白激酶等重要功能基因研究。本书是近年来在中国菰和菰黑粉菌功能基因组学研究方面最新科研成果的系统总结，对从事生物化学与分子生物学、作物学、园艺学和植物保护等领域研究的科研人员和广大师生具有重要的参考价值。该书既是一本研究性专著，也可作为相关专业高年级本科生和研究生的教学参考书使用。

1 中国扰和北美沼生菰的驯化、育种、组学和功能基因研究综述
1.1 前言
1.2 中国菰和北美沼生菰的食用历史和经济价值
1.2.1 北美沼生扰的食用历史和经济价值
1.2.2 中国苏的食用历史和经济价值
1.3 中国菰和北美沼生菰的驯化过程和育种目标
1.3.1 北美沼生菰的驯化过程和育种目标
1.3.2 中国苏的驯化过程及育种目标
1.4 中国菰和北美沼生菰的组学研究
1.4.1 中国菰和北美沼生菰的基因组学研究
1.4.2 中国苏的转录组研究
1.4.3 中国菰的蛋白质组学研究
1.4.4 中国菰和北美沼生扰的代谢组学研究
1.5 中国菰和北美沼生菰的功能基因研究
1.6 结论和展望
参考文献
2 中国菰BELL基因家族的系统分析及ZlqSH1a/ZlqSH1b在促进水稻落粒中的功能鉴定
2.1 前言
2.2 材料和方法
2.2.1 植株样品
2.2.2 中国菰全基因组BELL转录因子家族分析
2.2.3 引物序列
2.2.4 ZlqSH1a和ZlqSH1b基因克隆
2.2.5 Z1qSH1a和Z1qSH1b的亚细胞定位
2.2.6 ZlqSH1a/ZlqSHIb基因过表达水稻株系的构建
2.2.7 种子落粒性检测
2.2.8 激光共聚焦显微镜观察
2.2.9 扫描电镜观察
2.2.10 转录组分析
2.2.11 候选基因表达量验证
2.2.12 统计分析
2.3 结果分析
2.3.1 ZIBELLs转录因子家族成员的鉴定及其染色体定位分析
2.3.2 ZIBELL基因的系统发育分析
2.3.3 ZIBELL家族基因的基因结构和保守基序分析
2.3.4 ZlqSH1a和ZlqSH1b蛋白的亚细胞定位
2.3.5 野生型与ZlqSH1a和ZlqSH1b过表达水稻的种子落粒表型和离层组织学分析
2.3.6 ZlqSH1a和ZlqSHIb过表达对水稻离层转录组的影响
2.3.7 种子落粒相关基因的表达及qRT-PCR验证
2.4 讨论
2.4.1 中国撒BELL家族转录因子的全基因组分析
2.4.2 ZlqSH1a和ZlqSHIb过表达植物与野生型之间离层组织学比较
2.4.3 ZlqSHIa和ZlqSHIb参与调控离层发育
2.5 结论
参考文献
3 代谢组-蛋白组学联合分析揭示中国菰米发育过程中籽粒着色的分子机制
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 样品和前处理
3.2.2 不同发育时期中国菰米的长度和重量测定
3.2.3 酚类化合物提取
3.2.4 总酚、总黄酮和总原花青素含量测定
3.2.5 基于UHPLC-QqQ-MS的类黄酮代谢组分析
3.2.6 游离氨基酸的提取和测定
……
4 中国菰bHLH转录因子家族的全基因组分析及ZIRc促进稻米酚类代谢的功能解析
5 菰黑粉菌的交配型位点对其交配和发育至关重要
6 两种菰黑粉菌菌丝交配时期转录组的比较
7 菰黑粉菌分泌的内切葡聚糖酶促进菌丝增殖
8 粉菌中丝裂原活化蛋白激酶UeKpp2的功能特征