但是，中西医之间也有矛盾的地方，尤其是现在，有以下几个趋势。第一，中医学是辨证论治，按症状体系说话，根据他的症状、主症来处方用药，或针灸、理疗等各种疗法来解决他的问题；但西医的话，是用西医学的这一套理论来解决问题的，这就出现了矛盾。比如说，临床用的“疏血通”这个药物，它的成分有水蛭和地龙，水蛭素是比肝素作用还强的抗凝药，可以活血化瘀，有血瘀症状就可以用。假设患者有消化道出血、脑出血，你给他用了疏血通，一旦出现医疗纠纷，就有问题了。在中西医之间出现矛盾的时候我们也必须要关注西医学的发展，包括中药学的现代药理，不能违背现代药理毒理来用中药，否则很容易出问题。再比如，一个偶发或者频发的室速、室早或者有严重传导阻滞的患者，你给他用洋地黄，大量的川乌、生附子，几十克，甚至上百克，违反了《中华人民共和国药典》（简称《药典》）的规定，一旦出现中毒的情况，那就会出现法律纠纷了，所以我们要关注这些。
还有一个比较矛盾的地方，就是现在有一些专家，他们在用中药的时候可能就会考虑，这几个药有降压作用，那几个药有抗心律失常的作用，麻黄附子细辛汤可能有治疗窦性心动过缓的作用，这是根据现代药理来指导用药，而我们中医传统上又要求辨证论治。这样的矛盾下，我们怎么处理问题？就我个人来看，我们还是应当以传统的中医理论为主，其他的一些理论，某些药可以治疗癫痫、治疗出血，像半枝莲、白花蛇舌草可以治疗肿瘤，等等，都可以适当地加进去。但是，还是要在中医理论的框架下来进行处方用药。而不能说看到一个肿瘤的患者，就用一堆有抗肿瘤药理作用的中药堆砌成方，这是不合适的。我们必须坚持用中医的理法方药体系来作为中医处方的核心，西医的理法方药则作为辅助。也可以西药中用，在这方面推荐大家学习一下张锡纯的《医学衷中参西录》，书名就提示了作者把中医当作灵魂，西医作为辅助的思路。
第二个问题，中医是时空医学，必须同时把握时间与空间两个方面。证候就是时空医学的重要载体。关于“证”，我很赞同姚梅龄老中医的说法，它是证据的意思，“候”就是时间。在《内经》里面我们可以看到“五日谓之候”，五天就是一个候，十五天就是一个节气，证候就是空间体系和时间体系的结合。所以中医治疗疾病强调“因时制宜，因地制宜，因人制宜”。在不同的地方、不同的时间，处方要有不同的思路。大家学习中医学，一定要对时空敏感，甚至可以说，离开了时间与空间的限制，中医就不成其为中医了。一个处方往往只是对这个人这个时间得的这个病才有效。中医证候的灵魂是一个对应的时空节点，我们必须掌握这个思路，才能从整体上把握中医。
还有，中医学是功能医学。我觉得这个落脚点在藏象学说，任何一个脏器都是要落实在一定的功能之上。不能拿中医的脏腑和西医解剖的器官做简单对应。一定要有功能医学的思维，才能有效解决问题。运化功能不好了，这才是脾的问题；肺不宣发，甚至排汗有困难，我们才考虑是太阳，是肺的问题。
还要提一点，人体的经络只在活体上存在，比如手太阴肺经，起于中焦，下络大肠，还循胃口，上膈属肺，从肺系横出腋下，下循孺内，行少阴、心主之前。这些都是以活体为基础的，离开活体去探讨，就没有任何意义了。
另外，经方是中医学的精华和灵魂。刘渡舟老先生，大家可能没见过，我去北京还听过他的课。他对经方现状感到悲哀，“我们以前硕士生、博士生都是要求去读《内经》《伤寒论》的，但是现在的这些研究生，哪个还会去翻《内经》，读《伤寒论》？关心的都是怎么去做实验，怎么去查生化指标，怎么搞老鼠！”刘力红教授也讲过，“要是哪个博士、博士后书桌上摆了一本《伤寒论》或者《内经》，不但不会被人认可，甚至还会被人笑话老土！”刘力红老师他自己对待经方的态度是“朝于斯，夕于斯，流离于斯，颠沛于斯”，对经典要早也看，晚也看，旅途要看，休息更要看。他的经方功底，我们可以在《思考中医》这本书中窥见一斑，完全是按照张仲景的伤寒学术体系展开的。
第三个问题，对于六经的看法，我们是先定位，后定性。用功能定位的思路，先定位，然后来定性。讲阳明的问题，手阳明大肠，足阳明胃，就是胃肠这块的问题。所谓定性，就是确定了是胃的问题，可以有寒证，也可以有热证。陆九芝在《伤寒论阳明病释》中讲，“伤寒有五，传人阳明，遂成温病”，就是说阳明病都是温病的思路。我认为这个是不对的，先定位，后定性，阳明只是定位，说明问题在胃、在大肠或其经络，凡是这几个部分的问题都是阳明病。而阳明不但有热证，也有寒证，讲到阳明病寒证的时候，张仲景写的是“食谷欲呕，属阳明也，吴茱萸汤主之”。吴茱萸汤还治厥阴病的问题，厥阴病其实也有寒有热，吴茱萸汤证就是厥阴寒证，当归四逆汤证也是厥阴寒证，白头翁汤证则是厥阴热证，乌梅丸证是厥阴病的寒热错杂证。定位，我们是按照功能来定的，你要定在阳明就考虑大肠和胃的问题，定在太阴就是脾和肺出了状况。《伤寒论》里面三阳的问题重在经络，三阴是重在脏腑的。但阳明的时候，已经是里证了，腑证也很重要，所以我们看到在阳明病篇有很多承气汤类方。
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