1. 科学性。本书分四个方面系统生动地向读者讲述了关于真菌的基础知识。第一章介绍了真菌在结构上的特征、生长过程，并回顾了人类发现真菌的历史；第二章介绍了食用性真菌；第三章介绍了作为病菌的真菌引发病变的机制和防治措施；第四章描写了真菌在现代医学和科技工业中的贡献。
2. 原创性。本书特别介绍了我国科学家在参与人类发现真菌过程中可歌可泣的经历，如中国的青霉素发明人樊庆笙博士、奠定了我国西南高等真菌研究基础的臧穆先生等。
3. 趣味性。本书通过拟人化的口吻，运用第一人称讲述了人类与真菌亦敌亦友的故事，风格诙谐幽默，寓教于乐。
4. 艺术性。整体包装设计采取图文并茂的形式，配以专业精美的说明性图片，充分调动读者的阅读兴趣。
我们在葡萄酒里，我们在面包里，我们还在你的鼻孔里。据人类科学家的保守估计，我们在地球上有150 万种不同的兄弟姐妹，然而你们却只认识我们中的0.5%。你们一些人把我们当作餐桌上的珍馐，一些人把我们视为包治百病的灵丹妙药，还有一些人则利用我们挽救了同胞的生命。在伴随人类成长的岁月里，我们与你们亦敌亦友，虽然“瘌痢头”“脚气病”给你们带来了不少困扰，但是我们分解石油、有效杀虫、防止土壤污染，为人类的发展也贡献了一己之力。
现在，真菌帝国派遣文化形象大使“小菌菌”，递交给人类50 份文件，全面展现真菌的食用价值、医药价值和文化价值。希望你们会了解并且喜欢上我们，珍惜我们共同生活的地球家园，携手迈向更美好的明天。
引言 我们需要聊一聊
恭喜你，你是我们真菌帝国为渺小人类所选中的信使，根据我们的情报显示，你们人类对我们真菌的国度极度缺乏认知，甚至还有不少的误解。从此刻开始，你将肩负起真菌帝国教化人类的伟大使命，将我们的知识和福音传播给你们那些呆头呆脑的同类。
那个， 你先别生气， 别……别合上这本书，我没有敌意。好吧，我反省一下，可能我的语气不是太好。那个，能不能先找个地方坐下，我们需要聊一聊。
你可以叫我小菌菌，我是真菌帝国的文化形象大使，肩负着向人类输出文化的任务。虽然你们人类在地球上才出现了没多久，但竟然不可思议地和我们真菌帝国有了各种各样的联系。所以真菌大帝派我到人类群体中访问交流，根据交流的回馈，我们将制订一系列和人类之间的外交政策。
请不要露出这种疑惑的眼神，不要以为你长得比我壮我就怕你。在我们的眼中，你们只不过是地球上新出现的小弟而已。你们的一举一动都被我们的“特务组织”所监视着。
对了，我的小舅子还托我捎一些话给你，就是下次当你们想要找他的时候，能不能不要再派猪了？被猪拱很丢脸的好不好。
你那是不明所以的眼神？一看你就没文化……不……不，你那是求知的眼神，一看你就是人类的希望。
我们真菌帝国被你们人类最新分成五个门：子囊菌门、担子菌门、壶菌门、球囊菌门和接合菌门。我小舅子就是松露，听说过吗？不对，不是松露巧克力，那里面没有我的小舅子。也不对，我小舅子和蘑菇的关系很远。你们吃的蘑菇大部分都属于担子菌门，我小舅子则属于子囊菌门。所以，我小舅子和蘑菇的区别差不多等于你和隔壁老王。
好了，话说回来，我们说说猪的事情。我知道我小舅子与鱼子酱、牡蛎、鹅肝齐名，都是欧洲食谱中昂贵的奢侈品。因为我小舅子有一种非常特殊的气味，你们人类有的说像蒜头，有的说像蜂蜜，有的说像麝香，还有人非说像长年未洗的床单，甚至还有人形容我小舅子的气味像精液。这些他都忍了，他觉得这无非是他的魅力难挡，菌格闪闪发光的缘故。但他不能忍的是，仅仅因为他生活在地下，你们人类为了寻找他， 竟然习惯把母猪当作收获松露的得力助手。我知道母猪的嗅觉极其灵敏，好几米外就能闻到埋在地下的松露。但要知道若是你们人类没有及时拦住，母猪找到松露时就会疯狂地将它拱出来吃掉。被母猪吃掉很没有面子，为此，我小舅子总是被其他的真菌嘲笑。
你们人类还说这是因为我小舅子的气味与公猪身上发出的雄性激素的味道十分相似，所以母猪才对他情有独钟。我小舅子长得又矮，现在一些嘴贱的菌友都给我小舅子取了外号叫作“小公猪”。哪个大老爷们儿愿意被人叫“小公猪”呀，什么？“小公主”？也不行！
总之， 真菌帝国中的松露族严正抗议人类继续宣传利用母猪寻找他们的故事。而且，现在人类基本也都是用狗狗来寻找了。狗狗多可爱，还不会吃掉我小舅子，别再整天母猪、母猪的，行不？
你别一副垂涎欲滴想要吃了我小舅子的样子。松露不是欧洲的特产，你们的云南也盛产。据说十多年前，你们这些不长眼的是拿松露喂猪的……哎……好了，你快把嘴角的口水擦擦，我是不会告诉你我小舅子住哪儿的。
接下来我们谈正事，我相信你一定猜不到我们真菌帝国已经和你们人类有了多么广泛的交集。我们真菌帝国是一个善良的集体，愿意为人类的生存发展提供善意的帮助。但也请人类遏制住贪婪的欲望，和我们一起和谐地生存在这颗珍贵的地球上。
这一次我只是想和你聊聊。因为要出使人类世界，我们真菌帝国进行了一次全菌动员，我把收集上来的信息整理成了50 份文件，希望你能了解并且喜欢上我们。
序言 生命的第三世界
引言 我们需要聊一聊
第一章 我们从哪儿来，要到哪儿去？
我们才不是植物，我们有自己的帝国
爬呀爬呀爬呀爬的菌丝
是孢子，而不是包子
十九世纪，终于被你们发现了
二十世纪，亦敌亦友
论菌菌的重要性
与天斗，与地斗，与线虫斗，其乐无穷
这个邻居真奇妙
第二章 有一种幸福叫作被你们吃掉
明明白白地被吃掉
有个巴西兄弟下得了厨房上得了战场
金针菇，明天见
侧耳倾听
我就是蘑菇，你是在叫我吗？
小鸡炖的是个什么菇？
滑溜溜，我们滑溜溜
胖子不忧伤
茶树菇：只生在油茶树上的优质野生菌
你吃掉的是金耳还是银耳？
面纱与催情药
银耳妹妹的非洲姐妹
壮士，请喝下这碗鸡腿菇牌的墨汁
下雨天，草菇和酱油更配哦
我可不是猴子派来的
香？菇
不仅有口味，而且有颜值
四大野生名菌之首——咩咩胃
干巴菌与臧穆先生
自残的茭白
天灵灵地灵灵，灵芝到底灵不灵？
疯狂的冬虫夏草
第三章 向人类开炮
头皮屑和瘌痢头
令人“抓”狂的念珠菌
香港有一种特产
爱尔兰大饥荒
杀死那棵咖啡树
香蕉艾滋
波尔多之战
我们只不过是吃饭而已
野生的，天然的，怕怕的
第四章 不用谢我，我是雷锋
人类生命的成功大跃进
头上有个孢
蘑菇塑料
我们还会吃虫子
在一起！在一起！
你愿意嫁给我吗？ Yes， I do ！
挖矿这种小事就交给我们吧
喝下的是石油，拉出来的还是石油
影响人类进化的味道革新
面包会有的，馒头也会有的
从芝士到火腿
后记 我们一直在一起好不好？
真菌中文名和学名（ 拉丁文） 对照索引
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致谢
《菌物志》的故事很精彩，吃的故事、用的故事、治病的故事……让人时而平静，时而惊心动魄。语言是讲述者的功底，小菌菌博古通今，学贯中西，凡是和菌物有关的事都被她编进故事里，俏皮、灵巧的方式娓娓道来，让人意犹未尽。
——图力古尔，中国菌物学会副理事长、科普工作委员会主任，吉林农业大学教授、博士生导师