（五）向创新产业区的推进
尽管斗南集群内已经有一些企业与云南省农业科学院和农业院校进行合作，培育企业的自主创新和开发能力，但集群内的知识创新的动力有限，还没有进入创新产业区阶段。集群的发展开始出现了“三明治”格局。一方面，大量的花农仍然走低成本道路，在“低路”上出现了恶性竞争，利润空间越来越小，甚至很多花农出现亏本，从而在近年出现了大量重新转向蔬菜种植的现象。而且近年来，越南价格更低廉的玫瑰对以斗南为中心的花卉集群产生了很大冲击。另一方面，一些大企业虽然已经走上了现代化生产道路，积极开拓和占领国际市场，但高昂的国际运输价格和种苗的知识产权费却大大削弱了集群内花卉的国际竞争力。以月季为例，国际通行的品种授权费为每株0.8美元，折合人民币6.5～7.5元。每667平方米地种植4200～4500株种苗需要支付3万元左右的品种授权费，折算到每一枝月季花大约在0.06～0.10元之间。而集群内大量未经授权的自我繁育已经越来越受到国际市场的攻击，日本已经拒绝进口没有支付知识产权费的鲜花，斗南的康乃馨只有使用英茂公司种苗的康乃馨能够进入日本市场。
以斗南为中心的花卉集群落的花卉生产80%都是依靠农户生产，而走“低路”的农户已经开始制约集群的进一步发展。2002年，日本的一家企业原打算在斗南采购1亿元人民币的鲜花，却因为斗南大量的鲜花达不到他们所要求的品质，而不得不将采购量减半。斗南集群全面升级的关键是促进小规模花农由“低路”向“高路”的转型，而这需要依靠向更高标准的国际市场的扩展和市场的优胜劣汰机制。虽然，已经有一些花农走上了“高路”，通过拍卖市场和出口花商进入国际市场，但所占比例不大。主要是因为目前斗南仍然是以供应国内市场为主的集群，国内市场的需求有很大的差异，既有对高品质鲜花的需求也有对低品质鲜花的需求，大量低质廉价的鲜花可以被广阔的国内市场所吸收，集群内缺乏对“低路”模式的淘汰机制。在斗南还有一个很有意思的现象，很多花商自己也有种植鲜花，但他们自己种的鲜花不自己发，而是送到拍卖市场或以较好的价格卖给其他的花商。这说明了斗南花卉集群“高路”与“低路”的并行发展，全面升级可能还需要漫长的时间。而集群进一步升级的关键是向国际市场的渗透，通过国际市场的压力促进集群的升级。这需要解决的首要问题是国际运输能力和运输价格的限制，以及花卉知识产权的制约。而自主知识产权的突破是集群向创新集群过渡的关键。
因此，应积极促进集群内企业之间的相互合作，以及集群内企业与外部科研机构、外部企业的科研合作。目前，云南省花卉产业联合会为集群内的创业家们提供了正式交流的平台；集群内创业家之间也自主建立正式的合作和非正式的交流模式。这种正式或非正式的交流与合作促进了集群内知识和技术的溢出，创造了集群的创新环境。而且云南省政府正计划将云南省内的重点大学及科研院所迁至呈贡县，这将有利于为集群提供科研以及人力资源支持，为集群营造良好的知识创新环境。但创新的产生不是短期能够实现的，它是一定的知识积累为基础。而政府通过外部知识系统的植入以及企业通过科研人才的引入有利于加速这一进程。
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