《阮元经学研究》主要从以下几个方面论述阮元经学思想及经学文献整理成就：第一，讨论阮元的学术人生及其经学思想的形成。阮元经学思想的形成，既渊源有自，又有广阔的社会政治、地域文化、个体身份等背景，表现出阶段性特点。第二，讨论阮元经学文献整理的成就。具体包括：以《皇清经解》为代表的经学文献编纂成就，以《十三经注疏校勘记》为代表的经书文献校勘成就，以《经籍籑诂》为代表的经学训诂成就。第三，讨论阮元的经学研究成就。阮元撰著了大量的经学研究论文，有的是对经籍诸名物、典制的新考证，有的是对经学诸观念的新阐释。他所倡导的这些学术观念，在当时产生很大影响。第四，讨论阮元经学研究的特点。阮元的经学研究，主要表现出训诂与义理并重、崇古与求是兼顾、求实与致用结合。第五，讨论阮元经学对清中后期学术的影响。阮元作为一位高官兼学者，其致力于学术与经世的探讨，影响了清中后期学风的变化。嘉道时期汉宋兼采学风的出现、今文经学的兴起、重礼思想的产生，既是当时时势使然，也与阮元的倡导有重要关系。