《本草经疏辑要》为清代吴世铠所纂。吴世铠，字怀祖，海虞（今江苏常熟）人。全书共十卷。卷一为治病序例；卷二到卷八分为石金土水、草、木、人兽畜、禽虫介鱼、果壳叶六部分，共载药427味，每药多先录《神农本草经》原文，后加注释；卷九为《朱紫垣痘疹秘要》，卷十为吴氏所辑《集效方》。书中对病证的脏腑归属、临床表现、用药宜忌做了全面论述，药物主治交互参证，功用辑录详尽。其论全面中肯，语言简明平易，洽法切于实际。本次整理以清嘉庆十四年（1809）书带草堂初刻本为底本。

卷一
治病序例
阴阳表里虚实门
五脏六腑虚实门
六淫门
杂证门
妇人门
小儿门

卷二
石金土水部
丹砂
云母
石钟乳
紫石英
白石英
雄黄
磁石
阳起石
太阴玄精石
代赭石
硇砂
石硫黄
婶喑石
寒水石
石膏
滑石
赤石脂
花乳石
浮石
礞石
硼砂
珊瑚
砒霜
禹余粮
无名异
矾石
绿矾
石灰
密陀僧
自然铜
金箔
水银
灵砂
轻粉
铅
粉锡
铅丹
铅霜
芒硝
朴硝
元明粉
食盐
戎盐
古文钱
铁落
铁锈
银朱
铜青
伏龙肝
百草霜
梁上尘
孩儿茶
东壁土
黄土
井底泥
蚯蚓泥
水

卷三
草部上
人参
甘草
黄精
黄芪
干地黄
生地黄
熟地黄
白术
苍术
菖蒲
葳蕤
天门冬
沙参
石斛
麦门冬
薯蓣
薏苡仁
当归
牡丹皮
芍药
川芎
续断
蒺藜子
覆盆子
蛇床子
丹参

卷四
卷五
卷六
卷七
卷八
卷九
卷十