2.呼吸系统可表现为胸闷气喘、咳嗽咳痰、呼吸困难、喉头水肿等，一般由过敏反应引起，较少见。不当服用含有乌头碱的中药也可引起呼吸困难，严重时可因呼吸衰竭致死。
3.消化系统消化系统是最常见的受累器官。主要表现为食欲缺乏、胃部烧灼感、恶心呕吐、脘腹胀满，腹痛、腹泻、便秘、呕血、便血、肝功能异常等。大多数中药（如白芍）引起的消化系统不良反应以大便性状改变、轻度腹泻为主，一般不需特殊处理，减药或停药即可。乌头碱中毒时会出现恶心呕吐、腹痛腹泻等症状，应予以警惕。雷公藤等中药可引起急性肝损伤，表现为恶心呕吐、腹痛、黄疸、肝区叩痛等，多数患者停药后可缓解，其机制可能与雷公藤引起的炎症因子激活和释放有关。
4.泌尿系统患者可出现尿频、尿急、尿痛、腰痛、血尿、蛋白尿、排尿困难、尿少或无尿、水肿、急慢性肾衰竭、肾炎等。常见引起泌尿系统不良反应的祛风湿中药有马兜铃、广防己、马钱子、雷公藤、蜈蚣等。如马兜铃酸的肾脏毒性广为人知，它在体内蓄积，可引起毛细血管水肿并迅速进展为肾小管变性、坏死而导致急性肾衰竭；如病变隐袭，可于数年间进入终末期肾衰竭。
5.心血管系统临床可见胸闷气促、心悸、多种心律失常甚至室颤、血压异常、心力衰竭等。引起心血管不良反应的祛风湿中药以雷公藤和含乌头碱的中药如川乌、制草乌、附子等多见。乌头碱可直接作用于迷走神经和心脏，引起心律失常，甚至室颤致死。由于乌头碱的治疗剂量与中毒剂量相近，故应用应慎重。
6.生殖系统不良反应含雷公藤碱的中药如雷公藤总苷片、昆明山海棠等可对生殖系统造成影响。对生育期妇女可引起月经紊乱、闭经等。雷公藤碱对男性生殖系统尤为敏感，可使精子生成减少，精子活动度明显下降，甚至无精症。雷公藤对精子的抑制具可逆性，停药后可逐渐恢复。
7.神经及精神系统临床表现为头晕、头痛、嗜睡、乏力、口唇面部或肢体麻木、抽搐烦躁、神经炎等。主要由含生物碱的中药引起，如含士的宁的马钱子，含雷公藤碱的雷公藤和昆明山海棠，含乌头碱的川乌、草乌、附子等。乌头碱和士的宁急性中毒均可直接作用于中枢神经系统，引起肢体抽搐、惊厥、呼吸困难，甚至呼吸衰竭而死。雷公藤慢性中毒时主要引起神经细胞变性，表现为头晕嗜睡、肌肉酸痛、不宁腿综合征、烦躁等。
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