秦始皇骤然客死沙丘，赵高密谋政变，丞相李斯被利诱挟持加入密谋，终使秦帝国最高权力层发生巨大的黑洞变异：长公子扶苏自杀，掌握军权的蒙氏兄弟被害，胡亥称帝，赵高领政。秦帝国权力发生剧烈质变：二世集团残杀帝国功臣元勋及其他皇室成员，推行一系列暴虐昏政，大大激化了各种社会矛盾。
陈胜吴广大起义爆发，六国旧贵族趁势而起，形成天下反秦的燎原之势。章邯组织刑徒军镇压但最终失败。铲除二世集团的子婴回天乏术，宣布投降。项羽大军将帝国财货掳掠净尽，而后焚烧咸阳宫大火三月不灭，整个关中尽为八百里废墟，秦帝国骤然灰飞烟灭！
“ 中车府令功劳才具，老夫素无非议。”李斯很淡漠。
“ 丞相正眼相待，高必粉身以报！”
“ 大道之言，中车府令并未说完。”李斯淡淡提醒。
“ 大道之要，首在丞相不失位。丞相不失位，则法治大道存！”
“ 老夫几曾有过失位之忧？”
“大势至明，丞相犹口不应心，悲矣哉！”赵高嘭嘭叩着石案，“ 若按皇帝遗诏，必是扶苏称帝。扶苏称帝，必是蒙恬为相。赵高敢问：其一，丞相与蒙恬，功劳孰大？”
“ 蒙恬内固国本，外驱胡患，兼筹长策，功过老夫。”
“ 其二，无怨于天下，丞相孰与蒙恬？”
“ 政道怨声，尽归老夫，何能与天下尽呼蒙公相比。”
“ 其三，天赋才具，丞相孰与蒙恬？”
“ 兵政艺工学诸业，蒙恬兼备，老夫不如。”
“ 其四，得扶苏之心，丞相孰与蒙恬？”
“ 蒙恬扶苏，亦师亦友，老夫不能比。”
“ 其五，谋远不失，丞相孰与蒙恬？”
“ 不如……足下责之何深也！”李斯有些不耐了。
“ 以此论之，蒙恬必代丞相总领国政，丞相安得不失位哉！” “ 也是一说。”默然有顷，李斯点了点头。
“ 更有甚者，扶苏即位，丞相必有灭族之祸。”
“ 赵高！岂有此理！”李斯愤然拍案。
“丞相无须气恼，且听在下肺腑之言。”赵高深深一躬，殷殷看着李斯痛切言道，“始皇帝陛下千古伟业，然也有暴政之名。若扶苏蒙恬当国，为息民怨，必得为始皇帝暴政开脱。这只替罪羊，会是何人？自然，只能是丞相了。丞相且自思忖：天下皆知，李斯主行郡县制，开罪于可以封建诸侯之贵胄功臣；李斯主张焚书，开罪于华夏文明；李斯主张坑儒，开罪于天下儒生；而举凡刑杀大政，丞相莫不预为谋划，可说件件皆是丞相首倡。如此，天下凡恨秦政者，必先恨丞相也。其时，扶苏蒙恬杀丞相以谢天下，朝野必拍手称快。以蒙恬之谋略深远，以扶苏之顺乎民意，焉能不如此作为哉！”
“大道尽忠，夫复何憾？”李斯的额头渗出了晶亮的汗珠。
“丞相何其迂阔也！”赵高痛彻心脾，“那时只怕是千夫所指，国人唾骂。普天之下，谁会认丞相作忠臣，谁会认丞相为国士？”
“ 中车府令明言！意欲老夫如何？”突然地，李斯辞色强硬了。
“ 先发制人。”赵高淡淡四个字。
“ 请道其详。”
“ 改定遗诏，拥立少皇子胡亥为帝。”
“ 胡，胡亥？做，二世皇帝？”李斯惊得张口结舌了。
假如秦帝国没有速亡
—《大秦帝国•帝国烽烟》序 孙皓晖 i
楔子
第一章 权相变异
一 南望咸阳 一代名将欲哭无泪 1
二 赵高看见了一丝神异的缝隙 16
三 残诏断句 李斯的勃勃雄心燃烧起来了 24
四 眩晕的胡亥在甘泉宫山林不知所以 43
五 李斯开始了别出心裁的才具施展 53
第二章 栋梁摧折
一 三头合谋 李斯笔下流出了始皇帝诏书 75
二 长城魂魄去矣 何堪君道之国殇 87
三 连番惊雷震撼 汹汹天下之口失语了 114
四 李赵胡各谋 帝国法政离奇地变异 121
五 礼极致隆 大象其生 始皇帝葬礼冠绝古今 134
六 天下孜孜以求的二世新政泡沫般飘散了 144
第三章 杀戮风暴
一 灭大臣而远骨肉 亘古未闻的政变方略 163
二 蒙恬蒙毅血溅两狱 蒙氏勋族大离散 167
三 杀戮骨肉 根基雄强的嬴氏皇族开始了秘密逃亡 181
四 三公九卿尽零落 李斯想哭都没有眼泪了 198
第四章 暴乱潮水
一 大泽乡惊雷撼动天下 215
二 芒砀山逃亡者在刘邦率领下起事了 243
三 江东老世族打出了真正的复辟旗号 248
四 背叛迭起 六国老世族鼓起了复辟恶潮 260
五 陈胜死而张楚亡 农民反秦浪潮迅速溃散了 268
六 弥散的反秦势力聚合生成了新的复辟轴心 281
七 项梁战死定陶 复辟恶潮骤然颓势 296
第五章 残政如血
一 赵高给胡亥谋划的圣君之道 304
二 逢迎反击皆无处着力 李斯终归落入了低劣圈套 313
三 饱受蹂躏的李斯终于走完了晦暗的末路 333
四 赵高野心昭彰 胡亥做梦也没想到自己的结局 345
第六章 秦军悲歌
一 以快制变 老将章邯迫不得已的方略 358
二 多头并立的楚军楚政 367
三 河北危局 天下复辟者面临绝境 375
四 秦赵楚大势各异 项羽军杀将暴起 389
五 各具内忧 章邯刑徒军与王离九原军 408
六 巨鹿大血战 秦军的最后悲歌 418
第七章 帝国烽烟
一 天地莫测 赵高的皇帝梦终作泡影 434
二 帝国回光 最后秦王的政变除恶 439
三 轵道亭外的素车白马 447
四 烽烟废墟 帝都咸阳大火三月不灭 461
祭秦论 原生文明的永恒光焰
—秦亡两千二百十五年祭
一 暴秦说：秦末复辟势力的历史谎言 478
二 历史实践与历史意识的最初分裂 487
三 历史烟雾的久远弥散 498
四 认知中国原生文明的基本理念 509
五 走出暴秦说误区：秦帝国徭役赋税之历史分析 516
六 走出暴秦说误区：秦帝国法治状况之历史分析 523
七 走出暴秦说误区：秦帝国专制说之历史分析 533
八 秦帝国骤然灭亡的两个最重大原因 538
[ 中信版《大秦帝国》跋]
轴心时代的文明光芒 552
这一百多年来，一代中国人、中国学者研究历史，反而对自己文化的根和祖先看不起。孙先生的巨作站在自己国家民族的立场上，有名有据。这样的学者独立而不倚，了不起。
——国学大家 南怀瑾
《大秦帝国》的问世，彻底颠覆了"暴秦说"，是一次有根有据的翻案。作者以其特有的凝重笔触，无比丰富的史实，再现了大秦帝国在那个中华文明转折点上发挥的无可替代的作用，以及大秦帝国为中华文明所做出的无与伦比的贡献。在这个意义上说，长篇历史小说《大秦帝国》的历史认识价值，远远超出了小说文本和文学的价值。
——中国现代文学馆副馆长 李荣胜
《大秦帝国》确实是力透纸背、才华横溢的一部大书。它以宏大的历史意识，要为历史溯本清源。我现在想象，现在有红学，有儒学，以后很可能有秦学。
——评论家孟繁华