就章节安排来说，基本上来说，本文分为三大部分：导论、理论建构和应用研究。导论中，就全文的基本问题进行一般性介绍和导引。在理论建构部分，文章从第二章到第三章着重从理论方面探讨法律治理的制度关联、法律治理的制度框架；应用研究部分，文章试图把理论建构部分得出来的制度框架，应用于社会变迁中，得出法律治理的不同形态，并进而应用于当下中国法治建设的实际，进行比对之后，力图提出法治实现的对策。具体来看：
本文的第一章是导论。导论里面，着重说明几个问题：课题的时代重要性、课题研究具有什么样的意义、主要研究哪些问题、运用什么方法进行研究以及研究的基本思路和安排。从时代需要提出课题，进而确定课题研究视角。然后论述课题的研究意义，为课题研究提供意义说明。之后，把课题分解为多个具体有待本文研究的重要问题，为全文的章节安排奠定基础。然而，要想研究好这些问题，就必须选定恰适的研究方法。本文的研究方法主要是辨证历史唯物主义、制度分析法、利益分析法和逻辑实证主义。通过这些方法的运用，结合课题的内涵，把相关论证进行如下安排。
理论建构。本文的第二章和第三章，是论文的总论部分。第二章，首先要确定进行分析需要借助的理论前提。然后通过社会制度与法律治理的关系，找出二者具备的基本联系，为进一步论证奠定基础。而为了进一步详细论证，需要确定具体的关键视角。在完成这些分析准备之后，文章第三章主要围绕社会制度决定法律治理的具体路径展开论证。从制度基因、制度需要、制度表达、制度推动和制度决定五个基本的制度视角，解析法律治理的整个过程，从中分析出社会制度决定法律治理的具体路径。从而确立了一个普适性的理论框架，为在不同的社会制度中进行探讨提供了理论基础。
在理论研究之后展开的是实践研究。从第四章开始，文章主要论及的是臣民社会与市民社会的具体制度架构中法律治理的不同实现方式。第四章，把从第三章得出的理论框架应用到臣民社会中。从臣民社会制度架构人手，对该制度下的法律基点、分裂的法律需要和倾斜的法律表达进行分析，推导出臣民社会中恶法化的法律。
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