《马克思主义与西方新制度经济理论比较研究》从马克思主义与西方新制度经济理论两者历史发展演进和学科内在结构逻辑的角度，从理论上进行阐述和分析，重点就马克思主义经济学与西方新制度经济理论在理论基础、方法论以及对经济社会现实指导意义等方面进行了比较。

第一章 理论框架和体系比较研究
一、马克思主义制度经济理论的框架和体系
二、新制度经济理论的框架和体系
三、理论框架和体系的比较
第二章 分析方法的比较研究
一、马克思主义经济学的分析方法
二、西方经济学的分析方法
三、经济学分析方法的比较
四、经济学分析方法的创新
第三章 制度范畴比较研究
一、马克思主义制度经济理论中制度范畴的内涵
二、西方制度经济理论中制度范畴的内涵
三、制度范畴内涵的比较研究
第四章 假设前提比较研究
一、马克思主义制度经济理论的假设前提
二、新制度经济学理论的假设前提
三、假设前提的比较第五章 产权理论比较研究
一、马克思主义产权理论
二、新制度经济学产权理论
三、产权理论的比较
第六章 企业理论比较研究
一、马克思主义制度经济理论中的企业理论
二、新制度经济理论中的企业理论
三、企业理论的比较
第七章 制度变迁理论比较研究
一、马克思主义制度经济理论中的制度变迁理论
二、新制度经济理论中的制度变迁理论
三、制度变迁理论的比较