由乡村旅游资源的所有者进行直接的自主经营，一方面有利于调动他们的经营和管理的积极性，资源是自己的，经营好了受益的也是自己，为了得到更好的回报，当地村民就会充分发挥自己的聪明才智把项目经营好，对他们来说，这也是自己发家致富的一条路子；另一方面，农民自主经营还可以有效避免与外来者的冲突，如果由外来企业经营的话，在权责分配上容易发生问题，产生摩擦，而由农民自主经营，这方面的矛盾相对比较少。此外，农民自主经营还会促发当地人对自有资源的保护意识，为了更好地利用资源，他们在经营时也会注意保护性开发，而且由于对当地的乡村民俗、乡村文化了解透彻，他们在产品开发时，能够比较好地体现原汁原味的地方特色。
但这种自主、分散的小业户经营模式，越来越面临着发展的矛盾：
一是资金对农民来讲是很大的问题，由于农民投入的资金有限，对公共设施和旅游接待设施的建设有限，旅游接待规模有限，对乡村社区环境的改善有限，也没有能力开展广泛的市场营销，旅游吸引力有限。同时，乡村旅游发展到一定阶段以后，无论是扩大经营规模，还是产品花样翻新，都需要一定的资金，而对于自主分散经营的业户来说，后续发展资金也是个比较大的瓶颈。
二是农民文化素质不高，受到他们自身观念、知识水平以及“小富即安”思想的影响，经营的档次往往提不上去，旅游产品比较原始粗放，旅游服务水平不高，缺乏带动效应。同时缺乏长远规划，容易产生急功近利的短期行为。随着乡村旅游的不断发展，经营者日益增多，竞争会越来越激烈，然而经营者由于自身在经营观念、经济实力等方面的限制，面对竞争，可能会出现无力应对的局面，或者是采取恶性压价等不正当的竞争手段，导致村里整个行业的经营陷入恶性循环，最后影响产品质量的稳定和产品档次的提升。
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