《订正六书通》仿照《金石韵府》的体例，以《洪武正韵》统字。每一字楷书上列俗体字，下列《说文》中的小篆及反切，《说文》以大徐本《说文》为主。凡是《说文》中的部首字，均标明“建首”二字，然后列古文﹑籀文﹑钟鼎彝器以及秦汉公私印章。凡是《说文》所无者，均注明出处，自为注解，并引经史加以证明。此书为后世保存了大量的字的不同形体，闵氏《凡例》说：“灼然乖悖者，芟之稍涉疑似，安知古人之不出于疑似也，现当并存以俟千古。”凡是一笔一划不同者并录，保存了大量的字体。特别是其书引用的古器物和秦汉印章，为我们保存了大量的古体字，能够为我们的古文字研究提供一定的线索。《订正六书通》本身就是为了保存字体，也是研究汉字字体演变及书法篆刻的工具书。