首先是两者交易的标的物不同。以股指期货为例，股指期货交易的标的物是虚拟的指数，而商品期货交易的标的物是大宗现货商品。因此，股指期货对外部因素的反应比商品期货更为敏感，价格的波动更加频繁和剧烈，股指期货比商品期货具有更强的投机性。
其次是股指期货同商品期货的主要区别还在于到期日交割方法不同。商品期货合约持有到期时必须进行实物交割，一方给付货款，另一方交付货物。考虑到股指“现货”——股票指数的特殊性，世界各国推出的股指期货均采用了现金交割的方式。
再次，从价格判断来说，虽然商品期货对应的价值区间可从商品生产成本、运输成本、资金成本、交割成本并结合供求关系加以确定，但因现货市场一般没有权威和唯一的现货价作为参考，且现货价存在信息滞后和真实性问题，因此，商品期货投资者困惑的是，应以哪个地区的现货价作为分析基准价，才能更好地判断商品期货合理价格区间。商品期货价格理论、卜应参考所有地区现货价，但投资者很难做到。因此，可能出现部分地区的现货价因局部因素的影响而导致投资者根据该地区现货价作出错误判断。而金融期货的标的物是唯一的，且透明、公开、准确，不存在滞后问题，这使金融期货相对商品期货而言，市场效率更高。因此，金融期货期现套利不仅机会较少.而且套利空间也较小。而商品期货因为现货价格滞后，以及现货买卖不便，期现套利机会相对较多，套利空间也较大，这也是两者主要区别点之一。
最后一个区别点是两者套期保值盘信息价值的不同。商品期货套期保值盘是随机产生的，只要每天有生产经营活动，就可能产生套期保值盘，因此，商品期货套期保值盘的信息价值并不大。但金融期货套期保值盘具有较大信息价值，因为金融期货的套期保值盘不是随机产生的，机构投资者只有在行情发生趋势变化或出现重大利空时，才会进行套期保值。因此，金融期货套期保值盘具有趋势判断价值，跟踪金融期货套期保值盘的增减，就能够与机构“共舞”，在机构作出战略性仓位调整时及时出逃。例如，我国台湾的投资者就发现，跟踪QF11股指期货持仓，有判断指数趋势的作用。这也是金融期货与商品期货最重要的区别点。
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