虽然已经有一些开源软件商业化的成功企业，但这些企业还只是少数，而且有一些企业的背后还是有一些商业公司的背景在运作，完全依赖于开源软件自身来完整运作而又获取成功的企业还是非常之少，在开源软件走向商业化的过程中困难还是很多。大部分用户是通过自行下载那些自由免费的开源社区版软件的，只有一小部分人才会购买开源软件的商业版本及其所提供的技术服务，这与开源软件最初建立时所倡导的自由开放免费分发的初衷是有着密切关系的，而且开源软件最初只是一群技术爱好者的小众乐园的产物，其适用范围还多是在小众市场或是开发者自身所处的垂直行业，所以如何使开源软件产品的适用范围更广泛，能够适用更多类型的企业和行业也是需要关注的问题。
另外，大部分公司习惯性地选择和依赖那些历史久远、品牌知名度高的传统商业公司来作为他们的提供商，认为这些传统的商业公司可以替他们承担风险，提供更完善可靠的服务支持，而开源软件公司是新兴的企业，小规模的公司为数众多，在与那些商业公司竞争的时候会面临一些困难，目前常见的方式是和一些传统的商业公司合作，通过间接的方式来施行开源软件商业化的策略。从目前来看，混源软件这种过渡的方式将会成为一种流行的商业模式，从现在一些商业软件公司和开源软件公司相互融合渗透的一些案例可以看出这一趋势。
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