《回回药方》的命名，说明该书是一部回回民族医药学的著作，书中也多次提到古回回医人、回回药物等。因此，探讨回回一词的确切含义.也是研究该书所必然涉及的主要学术问题之一。
“回回”一词，最早见于宋人《梦溪笔谈》和《黑鞑事略》，指的是“回鹘”。在《辽史》《元史》《元典章》中，主要是指伊斯兰教和信仰伊斯兰教的人。在明、清两代的文献中，主要指回族，即回回民族。清代则又对我国信仰伊斯兰教的其他少数民族加称“回回”，如称新疆维吾尔等族为“缠回”，称甘肃东乡族为“东乡回”，称青海撒拉族为“撒拉回”等。据于文中氏考证，我国宋代以前把信仰伊斯兰教的国家和人称为大食国或大食人，而大食原是波斯文tazt或tazin的译音，是波斯人用来称呼阿拉伯人的，唐、宋时回回人差不多都是阿拉伯人。元代，“大食”一词开始为“回回”所取代，此时来中国的阿拉伯人比任何时代都多。《明史·西域传》中有“今回回皆以中原为家，江南尤多”及“元时回回遍及中国”的记载。据《元史·百家志》记载来看，当时从中央到地方各级政府，几乎都有回回人参加诸如军事、建筑、天文、医药卫生等方面的工作。
关于《回回药方》的作者，由于残本缺少署名、序跋、题款，加之该书既不见载于史书，又未收入历代书目，故既往一直是学术界探讨和研究的重点之一。高晓山根据本书文字中大量中国北方口语，如至今只在北京地区见到的“黎鸡儿”名称等，推断《回回药方》的作者是一位长期居住在北京，或者生在北京，熟知阿拉伯医学又在一定程度上懂得中医中药的穆斯林，也有可能祖籍在新疆一带，而不是中南亚人。韦以宗则认为，该书为元代回回药物院的回回医所编。笔者认为，本书是用汉文，且夹杂少数阿拉伯文写成的，说明作者兼通汉文及阿拉伯文；从本书内容来看，其学术思想是以阿拉伯医学为滥觞的，其中虽有不少中（汉）医药知识，但学术体系与我国传统的汉医学迥然不同，说明作者是我国古代回回医人；从元、明诸代史书、书目均未见载，医书未见引用，且本书未能刊印等情况来看，其作者可能是一位民间医生。
《回回药方》的成书年代，也是不少学者关注的问题。谢仲墨、于文中等认为在元代。1984年，高晓山、马堪温曾提出，回回药物院成立于1292年，《饮膳正要》成书于1330年，推测《回回药方》比《饮膳正要》略早或同期；1987年，高晓山又据《回回药方》用北平地名，推测其成书年代应是明·洪武元年（1368年）至永乐元年（1403年）35年间，不是元代著作。据笔者查考：“回回”一名自元代开始成为在中国定居的阿拉伯人的通称。回回药物院的成立，标志着以阿拉伯医学为主体的回回医在中国正式传播。然而，这些只能作为判定《回回药方》一书成书年代的上限的依据之一，并不能等于成书之年。根据残本的内容可以看出，《回回药方》是一部以阿拉伯医学为主，同时又吸收了不少中（汉）医药学内容的中国古代医药学著作，这正是多数学者赞同的观点，那么，考察残本药方中所用的某些中药见载的时间，将是判断该书成书年代的重要依据。如残本卷十九中所用的无花果一药，为桑科植物无花果的干燥花托，主产于我国南方各地，其功能为健胃清肠，消肿解毒；作为药物，无花果首见载于明朱埭的《救荒本草》，而不见于宋、元以前诸家本草典籍。又如残本卷十二所用“阿夫荣”（一名阿肥荣），原书注云：即是黑御米子熬成的膏子，此药即鸦片。《唐本草》中虽已收载，但名为“底野迦”，至《本草纲目》始以“阿芙蓉”之名见载（阿夫蓉与阿芙蓉、阿肥蓉同药而同音）。《本草纲目》卷二十三“阿芙蓉”条下李时珍日：“俗作鸦片，名义未详。或云阿方音，称我也。以其花色侣芙蓉，而得此名。”李氏又日：“芙蓉前代罕闻，近方有用者，云是罂粟花之津液也。”
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