预成论战胜渐成论并且不断兴盛，得益于一种实验仪器——显微镜，显微镜的使用使得许多学者离开了渐成论的阵营。但是，早期的显微镜显然并不具有很高的品质，胚胎学家们无法观察到发育的早期阶段中的细节，于是一种预成论的生殖发育思想渐渐流行。科学理论的预成论可以说是从马尔比基——他造成的胚胎学史上最著名错误被人们称为“半生不熟的思想”——发表的一篇胚胎学论文开始的，这篇论文里马尔比基公布了他使用早期的、品质不高的显微镜所看到的胚胎发育细节，这些细节是之前的胚胎学家没有揭示的。
与拉马克主义相对立的达尔文主义，确切地说，新达尔文主义则主张一种预成论的生物进化思想。新达尔文主义站在拉马克主义的对立面上，彻底否定拉马克主义重要思想之一的获得性遗传法则。19世纪下半叶，细胞学取得了很大进步，这使得生物学突飞猛进，在这样的背景下，魏斯曼根据小鼠尾巴切割实验得到的成果，否定拉马克主义的获得性遗传法则。魏斯曼发现，对小鼠的尾巴进行切割，当实验进行到第22代时，小鼠的尾巴并没有变短，这表明外部环境的影响并不能改变生物个体的基因性状。以此为反例，魏斯曼使获得性遗传法则失去了必然性。新达尔文主义者通过否定获得性遗传法则.进一步否定了外部环境能够对生物个体产生影响。他们认为，生物的基因性状非常稳定，其变化都是内部的而非由外部环境引起的。但是，新达尔文主义否定外部环境影响的缺陷是显而易见的。以人类为例，依照新达尔文主义否定外部环境对生物个体性状能够产生影响的观点，那么就会出现原始人类到现代人类的发展中，基因性状的改变完全是依靠遗传信息的复制偏差或称拼写错误而产生的，现存的人类都是基因的有利变异经过自然选择的结果。
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