与火力发电相比，核能发电也有自己的一些缺点，主要问题如下：
（1）核电厂的反应堆堆芯内有大量的放射性物质，如果发生核事故，放射性物质则会释放到外界环境对生态及民众造成严重伤害，例如切尔诺贝利核电站事故、日本福岛核电站事故等。
（2）核电厂的建造和厂址选择会面临一些政治纠纷。对于核电有这样一句说法“谁都希望用上核电，谁都不希望建在自家门口”，这是由于我们目前对核知识的普及较少，公众缺乏对核电的正确认识，另外人们也担心类似福岛核电站事故那样的事故发生。所以我们应从儿童做起，加强对核知识的普及，同时进一步研究安全性能更高的核电站。
（3）核能电厂会产生一些放射性废料，或者是使用过的乏燃料，虽然所占体积不大，但因其含有较强的放射性，所以后处理也较燃煤发电难。
（4）核能发电的热效率较低，因而比一般的火力发电厂排放更多废热到环境中去，故核能电厂的热污染较严重。
（5）核能电厂前期的投资成本远大于火力发电厂。
（6）核能电厂较不适宜做尖峰、离峰的随载运转。
哪些地方适合建压水堆核电站，对地理环境的要求有哪些
核电站的厂址选择是个非常严格，也是非常复杂的系统工程，因为选址就是防范事故的第一道关。其基本原则是如果万一出现事故，要使其造成的损失最小，对周围环境影响最小。国际上通行的核电站选址的四个原则是技术、安全、环境和社会。
核电站的选址既要考虑厂址及其周围自然环境条件，例如
（1）核能发电不像火力发电那样排放巨量的二氧化碳、二氧化硫、灰渣等污染物质到大气中，因此核能发电不会造成空气污染。
（2）核燃料能量密度比石油、煤等燃料高上几百万倍，故核能电厂所使用的燃料体积小，运输与储存都很方便。当然由此产生废弃物也较少，废弃物的运输和储存压力也较小。
（3）核能发电的成本低于火力发电成本，而且世界各国的铀的储备几乎相当，其发电成本不容易受到国际经济情势影响，故发电成本较其他发电方法为稳定。
（4）核能发电对公众产生的照射剂量小于燃煤发电。核能发电对公众产生的照射剂量涉及核燃料循环。核燃料循环是指铀矿开采、铀矿石水冶、铀的浓集与转化、核燃料元件制造、核反应堆运行、乏燃料后处理、退役和放射性废物管理以及有关的科研和开发活动。在这些活动中会对局部地区的公众产生某种程度的辐射剂量。2000年的资料显示，核能发电造成全世界的人均年有效剂量为0.0002毫希，而且还会随着技术的完善而降低。如果按每人接受的剂量为0.01毫希计算，由于核电厂辐射致癌的可能性为千万分之一点五。和我们日常生活中的所熟知的香烟的辐射致癌的危险相比，不到每天吸一支烟的致癌率的五分之一。燃煤发电对公众的照射主要来自于煤的开采、煤渣释放的放射性氡。煤中含有痕量的天然放射性核素，煤的燃烧导致这些天然放射性物质向环境中排放，引起它们从地球深部到地表的再分布，从而变更了周围环境的辐射场和居民的照射。燃煤发电时煤的燃烧温度达1700，煤中大部分矿物熔合到玻璃样灰中，部分较重的灰掉入炉底成为炉底灰和炉渣。飞灰则随同热气流和挥发性无机化合物进入烟道，一部分被收集，余下的逸散飞灰进人大气。由于煤中的有机成分在燃烧的过程中消除，煤灰和煤渣中放射性比活度会提高近一个数量级。另外，飞灰被用于制造水泥、混凝土、用作路面稳定剂等作用时，也会引起公众照射剂量的增加，不过这部分增加的照射剂量很小。
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