转化医学作为一种全新的医学研究模式，正式兴起至今刚刚走过十个年头，由于其倡导“从临床出发”，“以病人为中心”和“多学科交叉”的往复式研究特点，并借助系统生物学研究平台，因而是从基础研究到获得满足临床诊疗需求的新技术、新方法最有效和最经济的模式，从而迅速成为各国医学研究人才聚集和投资的重点。虽然中医药界的一些有较大影响力的人物出于他们对中医药现代化发展模式的深刻认识，对中医药开展转化医学研究给予了高度重视和推动，但由于整个中医药学界的保守思维不是短时期内能彻底改变的现状，因而实际进展相对缓慢。绝大多数中医人还未意识到在不久的将来会面临“洋中医”的严峻挑战（我在2004年曾呼吁过要警惕“洋中医”的到来），特别是系统生物学和转化医学的兴起必将会加快“洋中医”来临的步伐。然而，挑战和机遇并存，加快中医药创新发展是当务之急和我们共同的任务。

　　我们的想法就是加入中医药元素。这里面有一个根本性的哲学性的问题，未来世界是东方化还是西方化。西方的主流认为，随着社会制度和价值观的融合，是全球西方化。这叫“历史的终结”。“9·11”事件之后，哈廷顿预言，东西方文化将导致“文明的冲突”。他指的东方文化不是中国的文化。而是指伊斯兰的文化，他认为是东方文化的一种。他认为，东西方文明的冲突不可调和，世界有可能灭亡。第三种看法由美国科学院院士尼斯贝特提出希望通过对东西方思维差异的理解和融合后，实现世界的大融合。
　　我本人赞同第三个观点。我并不认为历史的终结最后是全球的西化。那么，我们中医药的地位到哪里去了？有的时候文化还是很重要的，但是我并不认为中国文化、东方文化是一种排他性的，最后是要把西方文化消灭掉。我认为，东西方文化应该融合上升为一种新的文化。这实际上并不是我个人的观点，或者说我是参与形成这个观点的。因为在16个部委制订《中医药长期发展纲要》的时候，提到中医药现代化最终的目标是什么。我的观点是：东方与西方文化的融合。最后能写在《纲要》里面这句话是很多科学家的一个共识。中医药创新发展的总体目标之一，是促进东西方医学优势互补，相互融合，建立中国特色的新医药学。
　　新医药学是既源于西方医学，又要高于现在的西方医学；既源于东方医学，又高于现在东方医学的一种新医药学。为什么叫系统医学？就是中医药应该从自己解释自己的封闭系统转化成为容纳百川的开放系统。如果中医药老是用现代科学去解释古人所说的，那就仍是一个封闭系统。即使你用了现代科学技术，还是自己解释自己。但是如果把现代科学技术用进去以后，通过结合、整合、融合，就会上升到一个新的高度，那就不一样了。刚才说到中医药怎么表达的问题，现代的中医药所用的语言。但我并不认为是语言翻译的问题。我认为，中医药要为世界所接受，很重要的一个问题，即现代科学的一个基本特征就是用数据来说明问题，从数据中得到结果。
　　……

中医药转化研究的若干思考
基础与临床的相互转化是中医学发展的主线，文献到临床的转化是重要的补充
转化医学与中医药系统生物学
转化医学对中医药发展的启示
转化医学与中药物质基础组分结构研究
中医药转化医学研究的模式思考
中医药与转化医学的未来发展模式与思考
转化医学与循证医学
转化医学与新药研发
转化医学理念与中医药发展新机遇
从中医药防治乳腺癌癌前病变谈转化医学
转化医学与中药物质基础组分结构研究
基于转化医学新理念的中药学复合型创新人才培养思考
对中医药转化研究的几点认识
中医本身即转化医学
转化医学驱动下的中药研究与开发
中医药学与转化医学结合的模式与展望
中药与转化医学研究的思路和方法
开展中医药临床领域的效果比较研究
专家简介
部分媒体报道