鉴定奥茨的死因耗费了很长时间。以前人们认为他可能在一场突发的春季暴风雪中冻僵而死，然而2006年秋的研究却得出了新的结论：奥茨死于致命的战伤。由于最初发现他并把他从冰里取出来时的粗心，奥茨的衣服遭到了破坏。在后来进行的尸体后续研究中，一位研究人员发现在他衣服的肩部有一个以前从未注意到的洞。根据这个洞，科学家发现了奥茨被忽视的伤，一支箭头肯定穿透了他的左锁骨下动脉。2007年，瑞士和意大利的研究人员运用新开发的医学扫描仪器来检查这位猎人的尸体，扫描结果确认了2006年的结论，即箭头刺穿了他左锁骨下动脉，引起大量失血，继而导致休克和心脏病发作。这个结论于2007年6月发表在《考古学杂志》，并于2007年6月11日被《华盛顿邮报》引用（不过似乎为了证明新观点产生的速度有多快，《洛杉矶时报》在2007年9月1日报道说有放射学家、病理学家和其他一些研究人员利用新的法医学技术和CT扫描进行研究后，声称他们认为箭伤造成的失血只是使奥茨昏迷过去，他的死要么是因为他在昏迷时头撞到岩石上，要么是他的敌人击打了他的头部）。对遗骸的进一步研究显示他的衣服上还有别人的血。他左侧衣服上的血迹较多，表明他死前可能与另一人或几人在一起，他可能用左肩扛过某个受伤的人。
奥茨健康状况的研究显示他有鞭虫，一种在各个历史时期肆虐的肠道寄生虫。他身上有57处碳文身，简单的点与线出现在他脊柱下端、左膝后部以及右手肘。X线显示他的这些部位可能患有关节炎，因此，目前我们还不清楚这些文身到底源自某种形式的针灸来缓解疼痛，还是标志着其他什么通过仪式。
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