从生物学和经济学角度来看，生物进化是生命单位（细胞、个体、群体和物种）在定居的前提下于不同水平上不断专业化和一体化的结果。《基因的理性：进化的生物学和经济学》是一本从社会学和经济学角度研究生物进化的论著，主要介绍包括：作为进化基本单元的基因是不被选择的，它因复制而长寿，使决策过程和行为结果具有完全理性；基因定居后形成了排他性产权结构，提高了专业化分工的程度，从而推动生物的进化，直至产生人类；之后，人类进化的根本在于社会性的起源和发展，群体内个体的专业化分工形成了社会，人类和动物的各种行为都是在个体之间的敌友指数联系基础上产生的。
　　《基因的理性：进化的生物学和经济学》适合高等院校、科研院所从事生物进化学习和研究的师生阅读，也可供对此感兴趣的读者参考。

第一章 绪论
第一节 生物学和社会科学的相互渗透 
一、生物学和社会科学的差异与渗透
二、生物学与经济学的渊源、异同与渗透 
第二节 个体识别和联系：进化理论的盲点 
一、个体识别是个体联系的前提
二、个体联系是群体形成的基础
三、群体内专业化分工是社会形成的基础
四、社会生活是研究人和动物区别与联系的桥梁
第三节 利他行为：进化理论的难点
一、利他行为的社会科学解释
二、利他行为的经济学解释
三、利他行为的生物学解释
四、利他行为理论的共同缺陷
第四节 选择的层次：进化理论的焦点
一、个体选择
二、群体选择
三、基因选择
四、多元选择
五、其他解释
第五节 基因的理性：本书作者的探索
一、生物学和经济学的融合：本书的探索
二、基因的理性、定居和专业化：一种进化理论

第二章 理性基因：进化的基石
第一节 基因的本质
一、基因的进化
二、基因的本质
第二节 完全理性、有限理性和非理性
一、完全理性、有限理性和非理性
二、有限理性的原因 
三、理性程度模型
第三节 完全理性的基因
一、适应和选择
二、生命单位的适应和选择
三、理性基因的生物学证据

第三章 定居：进化的前提
第一节 基因的定居
一、生物膜的组成、结构和功能
二、细胞的形成
三、细胞：基因的家园 
四、基因定居的意义
第二节 产权：定居的保证
一、细胞对基因产权的维护：细胞识别
二、组织器官对基因产权的维护：同工酶
三、个体对基因产权的维护：免疫系统
四、物种对基因产权的维护：同源蛋白质的种属差异和物种的生殖隔离
五、动物个体对产权的维护：领域
六、人类个体对产权的维护：恒产
七、人类对产权的强力维护：国家
第三节 定居是文明进化的前提
一、小麦和水稻：定居文明的伴侣
二、小麦：定居文明的缘起
三、水稻：定居文明的延续
四、定居的意义：物质和文明的积累

第四章 专业化和一体化：进化的机制
第一节 专业化和一体化
一、专业化
二、产业聚集和产业集群
三、一体化
第二节 核酸和蛋白质的专业化和一体化
一、单分子：繁殖困难、生存效率低
二、遗传密码：核酸和蛋白质一体化的桥梁
三、病毒：核酸和蛋白质的聚集、集群和专业化
四、细胞：核酸和蛋白质的一体化
第三节 生物结构进化的专业化和一体化
一、细胞：内部的分工
二、组织：细胞聚集和集群
三、器官：功能的专业化
四、系统：器官功能的一体化
五、个体：系统功能的一体化
六、两性：个体水平上生存和繁殖的专业化
七、婚姻：个体水平上生存和繁殖的一体化
八、群体：个体的聚集和集群
九、社会：个体水平的专业化分工和一体化
第四节 生物种类进化的专业化和一体化
一、上升进化：纵向一体化
二、分支进化：专业化
三、特异适应：个体水平的高度专业化
四、简化式进化：组织器官水平的高度专业化 
五、进化的专业化和一体化模型

第五章 个体：基因和模因的共同载体
第一节 基因和模因
一、基因：本能的遗传单位
二、模因：智能、文化和文明的基本单位
三、模因的基本特征
第二节 基因和模因的复制
一、基因的复制
二、模因的复制
第三节 个体之间的联系
一、亲缘关系指数
二、模缘指数。
三、敌友指数
第四节 个体之间的识别
一、人类敌友指数的识别
二、动物敌友指数的识别

第六章 个体行为中基因理性和模因理性的冲突
第一节 个体行为中基因理性和模因理性的四次冲突
一、有性生殖与无性生殖
二、杂交与近交
三、利他行为、利己行为、损人行为与搭便车行为
四、永生与死亡
第二节 基因与模因冲突的经济学原因
一、个体：基因股份组成的公司
二、产权与股权
三、经营权与股权的分离

第七章 敌友指数：个体行为的基础
第一节 行为发生的敌友指数分析
一、个体行为的敌友指数模型
二、个体行为的发生条件
三、个体行为的影响因素
第二节 群体大小的敌友指数分析
一、群体大小的敌友指数模型
二、群体变化的原因
三、群体效用增加的途径
第三节 利他行为的不对称性
一、模缘指数的不对称
二、亲缘关系指数的不确定
三、预期收益的差异

第八章 两性：个体生存和繁殖的专业化
第一节 性的产生和进化
一、性的产生
二、从无性到两性的过渡
第二节 两性的进化
一、两性形成的意义
二、两性形成的保证
三、两性的专业化分工
第三节 两性的繁育成本和遗传收益
一、繁育子代的成本
二、降低繁育子代成本的途径
三、繁育子代的遗传收益
四、提高遗传收益的方式

第九章 婚姻：个体生存和繁殖的一体化
第一节 彩礼：形成婚姻的条件
一、彩礼
二、彩礼的均衡
三、订婚
第二节 婚姻
一、婚姻的含义
二、婚姻形成的经济学条件
第三节 婚姻的形式
一、杂婚
二、群婚
三、时偶婚
后记
主要参考文献