可能有必要确保微生物的生长在加工前、不同的处理步骤中和加工后均保持在一个最低值。采用的抑菌控制措施应适应于特定产品在特定情况下的需要。在最终产品安全性和适用性方面产生的结果并不仅仅取决于初始微生物数量及过程的有效性，还取决于存活微生物在处理之后的生长和处理后的污染情况。因此，有必要确保所有微生物控制措施组合应该在处理前和处理后得到适当的预防措施的支持。
危险源可能会受到初级生产中和／或处理环境中预防措施的控制，这取决于污染来源和可能途径。当评估微生物的预防措施时，特别重要的是要知道预防措施影响的是哪些危险源以及在挤奶、加工和／或分销奶类产品时，采取的措施将危害污染奶制品的可能性降低到何种程度。没有受到预防和抑菌控制措施恰当处理的微生物危害，需要采取具有充分的综合性能的杀菌控制措施进行处理和控制。
只在使用点上具有成效的微生物控制措施必须与其他微生物控制措施进行适当的组合，同时应用。
当微生物控制措施组合是多目标性时，即当选择不同的单项措施时，使影响微生物生存的各个不同因素都成为控制目标，如pH、水活性，营养物质的可利用性等，此时微生物控制措施的组合是最有效的。在许多情况下，低强度的微生物控制措施的多目标组合可能比高强度的单一措施更有效。大量抑制或减少微生物数量的控制措施可能有协同作用，也就是说两个或两个以上措施之间发生了互作，使其组合效果大于单个影响的总和。因此，应用协同效应可让微生物控制措施的组合实施强度，比预期单项措施的强度要低。
当小型奶牛场灵活运用附件I的规定时，应特别注意允许偏差的本质及其对乳中危害水平的潜在后果。
应重视可有效消除人畜共患病向奶中转移的微生物控制措施的应用。同样，如果某些动物疾病在生产奶的畜群中出现，应特别注意世界动物卫生组织《国际动物健康规范》中的建议，将其作为具体的杀菌控制措施或对消除与这些疾病有关的动物卫生风险所必须的性能指标。
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