第一，人工物的产生及其使用对环境的影响。按照科学所获得的人工自然规律进行生产改造自然，合成人工物，创造人工世界时，所发生的过程，绝大多数是自然界中的事物在自然的状态下所不能发生的，很多时候与自然界本来发生的过程相违背，打断或干扰了自然界所发生的自然过程，如果处理不好，就会对自然界造成干扰和破坏。合成异丙苯的传统酸性催化反应就是如此。
第二，人工物生产及其使用对环境的影响。按照人工自然规律所合成出来的人工物虽然有些是自然界中所有的，但是，由于这些物质是按照大规模生产方式生产出来的，在一定时期内能够大量地进入原有生态系统中，从而使得原有系统中的这一物质的含量大大增加，影响到生态平衡，造成环境与生态的破坏。温室效应以及酸雨的形成就是如此。
第三，人工物生产及其使用对环境的影响。按照人工自然规律所合成出来的或产生人工物大多是自然界中所没有的，这类物质放置到自然界中，就会改变环境中的物质组成，以及很可能与环境中的其他物质发生各种各样的人类没有预料到的或没有有意识地研究的反应，干涉了自然界中本身所发生的自然过程，影响到自然的生态平衡。如CFCs类物质的使用造成臭氧空洞的例子就说明了这一点。
、实验科学的自然转向与环境问题的解决
为了减少实验科学应用对自然生态环境的损害，一个必要的措施是对实验方法和实验科学进行反思，让科学回归自然，将科学从实验室带到外在自然界，以大自然为研究对象，大力发展直接面对自然的科学——“真正的自然科学”（real nature science），如农学、林学、海洋学、大气学，等等，真正做到向外在自然学习，发现外在自然的规律，按外在自然规律办事，达到保护自然环境的目的。
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