《我们的学术生态：被污染与被损坏的》是一本基于对目前的学术生态进行反思的论文集。从我国的中学教育到高等教育，从论文的写作生产到国际汉学对国内学界的压力，从学校风气的形成到出版行业的生存，作者都有所涉足。

社科院的自我理由
保护大学生态
众声喧哗的大学论说——写在《大学之忧》丛书前面
形式理性化只是必要条件和最低标准
“文胜质则史”的真义——历史与现实中的佞史传统
历史与现实中的学术剽窃
汉学：人乎其内出乎其外——答《北京大学研究生学刊》编者问
警惕人为的“洋泾浜学风”
中国研究领域的“测不准”原理
不通家法
国学：“礼失求诸野”之后
清华国学和域外汉学
中国大陆学术出版的现状
中文能否成为国际学术的工作语言？——就《中国学术》杂志答记者问
知识生产：国脉所系
中等教育的自主精神——与高考落榜学生的通信
一团乱麻中的“文理分科”
先立其大与师道尊严
诸神与通识
千呼万唤“阅读传统”——由《中国文库》所想到的
巧舌如簧的失范状态——关于电视辩论的辩论